O Ca : alpha碳 打不出來... | Ca- C - N - Ca ↑ | ↑ psi H phi peptide的基本架構如上，兩個aa之間由peptide bond形成，有個很重要的特性是peptide bond是不可以旋轉的，但是alpha碳上面的兩個phi bond跟psi bond可以360度旋轉，因為 aa的特性不同所以使旋轉的角度也有所不同才能夠形成不一樣的secondary structure， 例如說在alpha helix的結構下，phi角度約-45~-50度，psi角度約為-60度，從這個課本 上的例子來看，這兩個角度並不會相同，其實也因為有這兩個角度的不同才讓分子有夠 自由的空間能夠形成更多種folding。 CD我印象中是測定二級結構最好最方便的一種方法，原理大概是類似把peptide丟進去， 利用分子旋光性的不同可以跑出一定的波長跟吸光度的圖譜，alpha helix、beta sheet及 random coil會有不一樣的圖譜，一眼就可以看出peptide是屬於哪種結構。 其中的random coil就是除了常見的helix、sheet以外的第三種沒有規律的結構，就是 peptide是隨意纏繞沒有規律的，應該就是你所要問的random conformation。所以你讀到 的資料可能是告訴你random coil這種二級結構在210-220nm的波長間會有最大的吸光值這 個特性。 ※ 引述《zinga (zinga)》之銘言： : 請問一下 secondary structure 的 phi角 和 psi角 都是相等的嗎?? : 還有Random conformation 和 Circular dichroism spectrum exhibits : a maximum in the 210-220nm 有甚麼關係?? : Random conformation 又是甚麼?? : 懇請高手解答 thx!! --

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