作者penx (...)
看板Chemistry
標題如何分析/描述一個chemical database?
時間Sat Sep 17 20:24:43 2011
現在手上有一個約400個化合物的database
裡面的結構都是一級與二級的amine
我們想要用一個2D的散怖圖來描述這個database
現在想到的方法是，將這個database丟到volsurf去
然後用probes去描述結構，產生一大群變數
然後將這些變數以PCA方法分析，來產生一個2D的圖
主要依照圖上的分佈，來判斷這個database的diversity或是裡面結構相關性
不知道這樣的方式是不是行得通呢？
或是有沒有人有類似經驗的？
感謝...
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