最近老師想做分子模擬計算,用得軟體是amber或namd;老師叫我列清單,要我 組一台電腦出來...,上網了解一下,發現amber和namd都有cuda的gpu運算,因此我是 打算組i7加兩張670或680顯卡,ram32G;主要模擬蛋白是紅血球,之後可能做些docking 動作,想請問的是以上述配備跑的時間會大約多長?(或換個方向問這樣的配備夠嘛?) 或者是能從那邊知道體系和計算量的相關算式;倘若計算量太過龐大,是否要組叢集? 還有一個問題是出來的data會須要到2t或以上的raid容量嗎? 謝謝,才進來沒幾個月, 老師丟了這個大任務給我,又沒地方問,弄的最近很頭大... 希望能從這邊得到一些幫助,在次感謝orz --

※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.117.31.155