作者fred79516 (芭樂就是芭樂)
看板Biology
標題[問題] 生物移動軌跡
時間Thu Mar 27 00:29:04 2014
【問題】：
想請問各位前輩，
有沒有什麼軟體可以達到分析多顆且自動分析生物移動軌跡，
或是有用過mosaic的前輩可以指點我一下，
謝謝。
【問題起因】：
我是非生物相關科系的學生，
因為實驗上的需要知道浮游生物在流場中的運動軌跡，
目前我使用imagej的mosaic來分析，
這是一個免費軟體，
好處是可以一次分析很多個生物，
而且能自動化(不需要一個一個點)的將生物的位置連成軌跡，
但是我分析出來的結果都相當的差，
歸咎原因可能是生物濃度太高，
以及生物隨著流場變化在顯微鏡下大小會略有差異，
所以軟體不容易分辨哪一顆是由哪一顆移動而成。
【個人看法】：
【參考資料/連結】：
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1F：推 CErline:你問問看婦產科有沒有精蟲運動分析的軟體 03/28 04:59
2F：推 jeffreytu:付費版本，我是有選項啦 03/29 07:18
3F：推 microball:particle tracking 的論文應該滿多的 查看看吧 03/30 15:42
4F：→ microball:主要還是要看你的影片 清晰度跟運動速度快不快等等 03/30 15:43
5F：→ fred79516:其實我的影片清晰度還算好，但是particle有大有小，另外 03/30 22:07
6F：→ fred79516:particle的速度蠻快的，而且量又蠻多的，所以很困擾。 03/30 22:08
7F：→ microball:這裡的演算法大致分兩型，使用重疊來追蹤物件， 03/31 06:21
8F：→ microball:或是使用物件在兩個 frame 間的移動最小化來推測軌跡 03/31 06:22
9F：→ microball:所以關鍵是你的兩個frame之間，物體有沒有重疊? 03/31 06:23
10F：→ microball:還是移動已經快到跑到別地方了？ 03/31 06:23
11F：推 jeffreytu:我這裡是有使用過cellsens 的Tracking 可自己去圈選要 03/31 21:57
12F：→ fred79516:兩個frame之間物體沒有重疊 03/31 22:08
13F：→ fred79516:因為流場的流動相較於生物自己的游動快很多。 03/31 22:11