作者fred79516 (芭乐就是芭乐)
看板Biology
标题[问题] 生物移动轨迹
时间Thu Mar 27 00:29:04 2014
【问题】:
想请问各位前辈,
有没有什麽软体可以达到分析多颗且自动分析生物移动轨迹,
或是有用过mosaic的前辈可以指点我一下,
谢谢。
【问题起因】:
我是非生物相关科系的学生,
因为实验上的需要知道浮游生物在流场中的运动轨迹,
目前我使用imagej的mosaic来分析,
这是一个免费软体,
好处是可以一次分析很多个生物,
而且能自动化(不需要一个一个点)的将生物的位置连成轨迹,
但是我分析出来的结果都相当的差,
归咎原因可能是生物浓度太高,
以及生物随着流场变化在显微镜下大小会略有差异,
所以软体不容易分辨哪一颗是由哪一颗移动而成。
【个人看法】:
【参考资料/连结】:
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1F:推 CErline:你问问看妇产科有没有精虫运动分析的软体 03/28 04:59
2F:推 jeffreytu:付费版本,我是有选项啦 03/29 07:18
3F:推 microball:particle tracking 的论文应该满多的 查看看吧 03/30 15:42
4F:→ microball:主要还是要看你的影片 清晰度跟运动速度快不快等等 03/30 15:43
5F:→ fred79516:其实我的影片清晰度还算好,但是particle有大有小,另外 03/30 22:07
6F:→ fred79516:particle的速度蛮快的,而且量又蛮多的,所以很困扰。 03/30 22:08
7F:→ microball:这里的演算法大致分两型,使用重叠来追踪物件, 03/31 06:21
8F:→ microball:或是使用物件在两个 frame 间的移动最小化来推测轨迹 03/31 06:22
9F:→ microball:所以关键是你的两个frame之间,物体有没有重叠? 03/31 06:23
10F:→ microball:还是移动已经快到跑到别地方了? 03/31 06:23
11F:推 jeffreytu:我这里是有使用过cellsens 的Tracking 可自己去圈选要 03/31 21:57
12F:→ fred79516:两个frame之间物体没有重叠 03/31 22:08
13F:→ fred79516:因为流场的流动相较於生物自己的游动快很多。 03/31 22:11