作者CloudTear (照片能吃嗎?口去~)
看板Biotech
標題[問題] 我的insert切不下來
時間Wed Aug 23 01:30:28 2006
不好意思,請高手幫幫我
1.就是我的目標基因 (insert,約400bp),接上T-A Vector,
送入E .coil中transform放大之後,
無法從T-A Vector 上切下來,
就無法把insert送去構築在我所想構築的另一個Vector上。
我是這樣做的:
有接inesrt(400bp)的T-A vector mini 取10λ
↓
用Sma I 切(25度,4hr) total:30λ
↓
做失活(80度,20min)
沈澱(total加到200λ,用phenol/chloroform,再用carrier+NaoAC+100%EtOH)
55度dry乾,溶ddH2O 23λ
↓
用BanHI切/有添加BSA(37度,3hr) 23λ全下補到total:30λ
↓
做失活(80度,20min)
↓
跑gel 2λ (argarose,1%)
只出現一條>2000bp的band(因為我只用100bp maker)
並沒有400bp的band
註
T-A vector : 2728bp
我想請問:
1.為什麼我的insert切不下來?
我用Sma I 、BanHI的時間都有加長 大約一倍了
也做了失活
需要的buffer不同,也有用phenol/chloroform啊
T-A vector上也確實有Sma I 、BanHI的切位
我的inesrt也確定有接在T-A vector上(送過定序)
我該如何處理?該改進什麼地方?
我在酵素的海報(我忘記哪間公司,好像是NETBIO)
對照時發現Sma I 、BanHI交叉點是「連續切位」
請問這是什麼意思?
會造成digestion失敗嗎?
2.若之後順利切下後
構築時(一端stick/一端blunt)又如何提高ligation成功率?
該注意些什麼技巧?
專題作不出來
推徵眼看就要到
懇請善心人士幫我一下
感恩~~鞠躬~~~
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當人們開始盤算的時候
上天就笑了
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◆ From: 220.131.222.191
1F:推 intotheman:你要不要把topo分別用兩個酵素切看看阿 會不會是mut到 08/23 01:40
2F:→ intotheman:digest site 08/23 01:41
3F:推 shunze:為啥切完還要做失活的動作及純化 直接跑電泳就好啦 08/23 12:33
4F:→ shunze:再從gel上elution 400 bp的片段就可以了 08/23 12:34