作者CloudTear (照片能吃吗?口去~)
看板Biotech
标题[问题] 我的insert切不下来
时间Wed Aug 23 01:30:28 2006
不好意思,请高手帮帮我
1.就是我的目标基因 (insert,约400bp),接上T-A Vector,
送入E .coil中transform放大之後,
无法从T-A Vector 上切下来,
就无法把insert送去构筑在我所想构筑的另一个Vector上。
我是这样做的:
有接inesrt(400bp)的T-A vector mini 取10λ
↓
用Sma I 切(25度,4hr) total:30λ
↓
做失活(80度,20min)
沈淀(total加到200λ,用phenol/chloroform,再用carrier+NaoAC+100%EtOH)
55度dry乾,溶ddH2O 23λ
↓
用BanHI切/有添加BSA(37度,3hr) 23λ全下补到total:30λ
↓
做失活(80度,20min)
↓
跑gel 2λ (argarose,1%)
只出现一条>2000bp的band(因为我只用100bp maker)
并没有400bp的band
注
T-A vector : 2728bp
我想请问:
1.为什麽我的insert切不下来?
我用Sma I 、BanHI的时间都有加长 大约一倍了
也做了失活
需要的buffer不同,也有用phenol/chloroform啊
T-A vector上也确实有Sma I 、BanHI的切位
我的inesrt也确定有接在T-A vector上(送过定序)
我该如何处理?该改进什麽地方?
我在酵素的海报(我忘记哪间公司,好像是NETBIO)
对照时发现Sma I 、BanHI交叉点是「连续切位」
请问这是什麽意思?
会造成digestion失败吗?
2.若之後顺利切下後
构筑时(一端stick/一端blunt)又如何提高ligation成功率?
该注意些什麽技巧?
专题作不出来
推徵眼看就要到
恳请善心人士帮我一下
感恩~~鞠躬~~~
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当人们开始盘算的时候
上天就笑了
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 220.131.222.191
1F:推 intotheman:你要不要把topo分别用两个酵素切看看阿 会不会是mut到 08/23 01:40
2F:→ intotheman:digest site 08/23 01:41
3F:推 shunze:为啥切完还要做失活的动作及纯化 直接跑电泳就好啦 08/23 12:33
4F:→ shunze:再从gel上elution 400 bp的片段就可以了 08/23 12:34