作者lovepig414 (pig)
看板Biotech
標題[問題] DNA定序之後的問題
時間Fri Nov 3 12:13:19 2006
各位大大
小弟以本實驗室的細胞株做了RT-PCR後，之後再做clone完後，送生技公司做定序，
定序完成後，上了NCBI做序列比對，發現自己做的定序和資料庫上的定序相似
度高達98%，我想應該是很高吧，所以推測此細胞應該是有此基因，然而，我的
老闆卻問我了一個問題，就是為什麼相似度不是100%?要我做回覆！
我自己想的結論是：
1.也許是機器的問題，本身就有錯誤率！(但是機器做出錯誤的
機率是很低的！)
2.也許是基因上本身就有一點不一樣，但是轉譯出的protein
，可能會是相同的！(這個可以做胺基酸比對得知。)
再來我就不太知道為什麼了，自己也上網站找尋了一下，但是真的找不太到相
關的資料，不知道板上的大大們，有沒有人可以幫幫我啊！再過幾天就要meeting，
可是我卻如此的不知所以然，救救我吧！ 感恩阿！
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.127.215.11
1F：推 forWinds:同種內的生物在個體間有種內變異...很正常... 11/03 13:19
2F：推 ssuny:PCR也是會出錯的呀...不是mutation應該就是PCR的問題 11/03 23:40
3F：→ ssuny:當然定序也可能出問題...去看一下定序的peak吧 11/03 23:41
4F：推 melodyrabbit:PCR很容易出錯阿,放大再放大... 11/04 02:22
5F：推 zerpher:DNA聚合脢用哪種？Taq?錯誤率多少？ 11/04 19:54