作者lovepig414 (pig)
看板Biotech
标题[问题] DNA定序之後的问题
时间Fri Nov 3 12:13:19 2006
各位大大
小弟以本实验室的细胞株做了RT-PCR後，之後再做clone完後，送生技公司做定序，
定序完成後，上了NCBI做序列比对，发现自己做的定序和资料库上的定序相似
度高达98%，我想应该是很高吧，所以推测此细胞应该是有此基因，然而，我的
老板却问我了一个问题，就是为什麽相似度不是100%?要我做回覆！
我自己想的结论是：
1.也许是机器的问题，本身就有错误率！(但是机器做出错误的
机率是很低的！)
2.也许是基因上本身就有一点不一样，但是转译出的protein
，可能会是相同的！(这个可以做胺基酸比对得知。)
再来我就不太知道为什麽了，自己也上网站找寻了一下，但是真的找不太到相
关的资料，不知道板上的大大们，有没有人可以帮帮我啊！再过几天就要meeting，
可是我却如此的不知所以然，救救我吧！ 感恩阿！
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.127.215.11
1F：推 forWinds:同种内的生物在个体间有种内变异...很正常... 11/03 13:19
2F：推 ssuny:PCR也是会出错的呀...不是mutation应该就是PCR的问题 11/03 23:40
3F：→ ssuny:当然定序也可能出问题...去看一下定序的peak吧 11/03 23:41
4F：推 melodyrabbit:PCR很容易出错阿,放大再放大... 11/04 02:22
5F：推 zerpher:DNA聚合脢用哪种？Taq?错误率多少？ 11/04 19:54