※ 引述《kaifish (喔.....................)》之銘言： : ※ 引述《limiya (陳小咩)》之銘言： : : 我想請問 : : 我利用一個軟體叫做Beacon_designer設計primer : : 然後跑出一推primer candidate後再去blastn看是否這個primer會和其他的sequence : : 我的問題是 : : 通常拿去blast的小片段primer sequence會blast到一堆其他的gene sequence 真的會有一堆嘛？你有沒有選定物種？還有正反股不在同一染色體上....抑或隔很遠 也是不必理會它........ : : 我blast了許久都找不到專一gene的primer : : 請問有人可以提供你們在設計primer上的經驗或是方法嗎? : : 謝謝~ : 提供一點小小的經驗給您參考 : 其實Blast出來的片段雖然很相似 : 但是可以看看〝完全一樣〞或是3'端相似的比例有多少 : 如果3'端一樣的比例很少，那麼設計出來的primer有時候還是可以使用的 : 另外，也許你可以去看一下那些完全一樣的序列 : 有時候不會以基因的名字表示 : 而是以當初做定序的clone編號命名 : 其實代表的是同一段基因 : 給您做個參考 : 如果有錯，也請大家指正，謝謝！ 3'-端的幾個BASE確實很重要，我的經驗是挑至少看3個BASE挑有G或C的 --

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