作者showponn (showpon)
看板Biotech
標題[求救] 蛋白質3D結構
時間Mon Feb 25 21:33:10 2008
通常要取得蛋白質3D結構資料的時候
很普遍的工具是Protein Data Bank這個資料庫 可以取得原子三維座標的資料
但是在使用過後我發現PDB裡的結構都是屬於complex
而不是以單一蛋白質為單位的資料
希望可以知道 有沒有什麼工具或是資料庫 有提供以單一蛋白質為單位的蛋白質結構資料
雖然知道從complex也可以找到我要的蛋白
不過我的實驗是需要大量的蛋白質去做計算 沒有辦法從PDB一個一個去看
希望大家可以幫幫忙摟 感謝感謝
如果問題問的不好 還請見諒
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 125.229.14.219
1F：推 lingon:找找看mmtsb toolset 裡面有沒有這個功能 02/26 00:13
2F：→ lingon:沒有的話, 自己寫個script把rmsd 差最少的monomer從file 02/26 00:16
3F：→ lingon:中抓出來. 反正都是txt file, 這種script 不難 02/26 00:17