作者showponn (showpon)
看板Biotech
标题[求救] 蛋白质3D结构
时间Mon Feb 25 21:33:10 2008
通常要取得蛋白质3D结构资料的时候
很普遍的工具是Protein Data Bank这个资料库 可以取得原子三维座标的资料
但是在使用过後我发现PDB里的结构都是属於complex
而不是以单一蛋白质为单位的资料
希望可以知道 有没有什麽工具或是资料库 有提供以单一蛋白质为单位的蛋白质结构资料
虽然知道从complex也可以找到我要的蛋白
不过我的实验是需要大量的蛋白质去做计算 没有办法从PDB一个一个去看
希望大家可以帮帮忙搂 感谢感谢
如果问题问的不好 还请见谅
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 125.229.14.219
1F：推 lingon:找找看mmtsb toolset 里面有没有这个功能 02/26 00:13
2F：→ lingon:没有的话, 自己写个script把rmsd 差最少的monomer从file 02/26 00:16
3F：→ lingon:中抓出来. 反正都是txt file, 这种script 不难 02/26 00:17