作者acer7410 (GERE)
看板Chemistry
標題[實驗] 量化理論計算(transition state)
時間Thu Sep 2 18:30:55 2010
小弟在做過渡態的計算遇到幾個問題,因為本身專長非量化計算,只懂一些基本方法.
想請教做量化計算的大大
問題一 : 我再跑transition state時,得不到paper中所講的負特徵值.
問題二 : 要是我設定 RMS 小於 0.0001, 這樣所得到的結構符合嗎
問題三 : 我使用的軟體為 wavefunction spartan 和 Chem3D_MOPAC的介面.
在spartan中 transition geometry/PM3 往往超出計算次數,
因此修改 OPTCYCLE=1000次,但始終得不到負特徵值.
另外,在MOPAC/PM3 當中run到一半就停止了,相當奇怪.
我再三確認過結構與電荷,整體都沒錯誤,但就是run不出來.
跪求,量化的大大傳授心經.
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.118.140.167
1F：推 woodwild:我的經驗 可能是下的指令問題 09/02 20:35
2F：推 woodwild:如果你是剛碰要算TS 建議先算一些可以得到比對的小分子 09/02 20:39
3F：→ woodwild:等到確認OK 再算你要的分子 TS的結構的微調也會有影響 09/02 20:40
4F：推 woodwild:一般錯誤訊息會給你資訊 告訴你是哪裡的問題 09/02 20:44
5F：→ acer7410:我放大到 optcycle=4000 才找到~~ 09/03 21:07