作者acer7410 (GERE)
看板Chemistry
标题[实验] 量化理论计算(transition state)
时间Thu Sep 2 18:30:55 2010
小弟在做过渡态的计算遇到几个问题,因为本身专长非量化计算,只懂一些基本方法.
想请教做量化计算的大大
问题一 : 我再跑transition state时,得不到paper中所讲的负特徵值.
问题二 : 要是我设定 RMS 小於 0.0001, 这样所得到的结构符合吗
问题三 : 我使用的软体为 wavefunction spartan 和 Chem3D_MOPAC的介面.
在spartan中 transition geometry/PM3 往往超出计算次数,
因此修改 OPTCYCLE=1000次,但始终得不到负特徵值.
另外,在MOPAC/PM3 当中run到一半就停止了,相当奇怪.
我再三确认过结构与电荷,整体都没错误,但就是run不出来.
跪求,量化的大大传授心经.
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.118.140.167
1F:推 woodwild:我的经验 可能是下的指令问题 09/02 20:35
2F:推 woodwild:如果你是刚碰要算TS 建议先算一些可以得到比对的小分子 09/02 20:39
3F:→ woodwild:等到确认OK 再算你要的分子 TS的结构的微调也会有影响 09/02 20:40
4F:推 woodwild:一般错误讯息会给你资讯 告诉你是哪里的问题 09/02 20:44
5F:→ acer7410:我放大到 optcycle=4000 才找到~~ 09/03 21:07