作者gogomanX (勾勾麵)
看板Chemistry
標題[學習] 關於GAUSSIAN軟體
時間Tue Oct 5 12:43:29 2010
請問有版友對gaussian這軟體有研究嗎
最近我們實驗室剛開始使用這套軟體計算分子的HOMO和LUMO及DIPOLE等
但運算完後的分子結構常常會和輸入的結構有所差異
如多了一個奇怪的單鍵連結兩個有點距離的C和H
麻煩知道的版友幫個忙吧 謝囉~ 也可以請你喝飲料表達謝意XD
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◆ From: 140.112.148.76
※ 編輯: gogomanX 來自: 140.112.148.76 (10/05 12:43)
1F：推 sexyrickysky:如果你有下opt指令結構會變化是正常，因為opt指令就 10/05 16:16
2F：→ sexyrickysky:是調整結構到最佳化的意思。如果你下sp指令，照理說 10/05 16:16
3F：→ sexyrickysky:是不會有結構變化的。他只算當下結構的能量，並不作 10/05 16:17
4F：→ sexyrickysky:結構調整。Gaussian view所畫出來的那些鍵節基本上 10/05 16:17
5F：→ sexyrickysky:並沒有特別的意義，不會影響到你計算的結果，那個只 10/05 16:18
6F：→ sexyrickysky:是電腦計算完後，依照結果判斷原子間可能的鍵節情況 10/05 16:18
7F：→ sexyrickysky:應該有user ref.吧，裡面都有講各指令的意義。 10/05 16:19
8F：→ gogomanX:感謝樓上的回答 我的JOB TYOE確實是選opti to minimum 10/05 17:08
9F：→ gogomanX:可是這樣他把H接上兩個C 感覺不是不太合理嗎? 10/05 17:09
10F：→ gogomanX:有辦法要他做最佳化結構 但不加上額外鍵的指令嗎? 10/05 17:10
11F：→ gogomanX:不最佳化的話算出來的HOMO和DIPOLE應該會跑掉吧@@ 10/05 17:10
12F：→ sexyrickysky:那個鍵節只是參考用的，電腦幫你判斷出來可能會有鍵 10/05 17:28
13F：→ sexyrickysky:生成，不一定準確。所謂的鍵節不要單存想說只是某某 10/05 17:29
14F：→ sexyrickysky:原子與另外一個原子共用電子才會產生鍵節。 10/05 17:30
15F：→ sexyrickysky:舉例來說，一般大家會認為氫原子軌域最多只能再接受 10/05 17:30
16F：→ sexyrickysky:一顆電子與其它原子形成共價鍵。但這只是過渡簡化的 10/05 17:31
17F：→ sexyrickysky:價鍵理論倒出得到的結果。所謂的鍵節更精準的定義應 10/05 17:32
18F：→ sexyrickysky:考慮軌域的"混成"與重疊，你可以看看你的軌域圖， 10/05 17:33
19F：→ sexyrickysky:那個氫原子的s軌域是不是同時與臨進的兩個碳原子軌域 10/05 17:34
20F：→ sexyrickysky:有混成的情況。 10/05 17:34
21F：→ sexyrickysky:要判斷結構合不合理絕對不是用gaussian畫出來的鍵節 10/05 17:35
22F：→ sexyrickysky:判斷，再強調一次，那個只是方便我們人類做為參考， 10/05 17:35
23F：→ sexyrickysky:結構的合理性判斷方式有幾個最基本但好用的方法： 10/05 17:36
24F：→ sexyrickysky:使用頻率分析確認，看看是否存在虛頻。 10/05 17:36
25F：→ sexyrickysky:比較特定能量數值，看看是否與實驗直接近。 10/05 17:37
26F：→ sexyrickysky:比較實驗值與理論值的重要幾何參數。 10/05 17:37
27F：→ sexyrickysky:不過這邊要強調一點的是，gaussian在正常情況下都是 10/05 17:38
28F：→ sexyrickysky:假設分子在氣態0k情形下作計算，所以要比較的話最好 10/05 17:38
29F：→ sexyrickysky:拿氣態的資料比較。 10/05 17:38
30F：→ sexyrickysky:如果你發現跟你的實驗結果差距很大，那表示可能產物 10/05 17:40
31F：→ sexyrickysky:存在多個穩定結構，你只找到其中一種。或是說，你的 10/05 17:40
32F：→ sexyrickysky:計算方法一開始就考慮得不周全所導致的錯誤。 10/05 17:41
33F：→ sexyrickysky:例如:level太低....等等 10/05 17:41