作者gogomanX (勾勾面)
看板Chemistry
标题[学习] 关於GAUSSIAN软体
时间Tue Oct 5 12:43:29 2010
请问有版友对gaussian这软体有研究吗
最近我们实验室刚开始使用这套软体计算分子的HOMO和LUMO及DIPOLE等
但运算完後的分子结构常常会和输入的结构有所差异
如多了一个奇怪的单键连结两个有点距离的C和H
麻烦知道的版友帮个忙吧 谢罗~ 也可以请你喝饮料表达谢意XD
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◆ From: 140.112.148.76
※ 编辑: gogomanX 来自: 140.112.148.76 (10/05 12:43)
1F：推 sexyrickysky:如果你有下opt指令结构会变化是正常，因为opt指令就 10/05 16:16
2F：→ sexyrickysky:是调整结构到最佳化的意思。如果你下sp指令，照理说 10/05 16:16
3F：→ sexyrickysky:是不会有结构变化的。他只算当下结构的能量，并不作 10/05 16:17
4F：→ sexyrickysky:结构调整。Gaussian view所画出来的那些键节基本上 10/05 16:17
5F：→ sexyrickysky:并没有特别的意义，不会影响到你计算的结果，那个只 10/05 16:18
6F：→ sexyrickysky:是电脑计算完後，依照结果判断原子间可能的键节情况 10/05 16:18
7F：→ sexyrickysky:应该有user ref.吧，里面都有讲各指令的意义。 10/05 16:19
8F：→ gogomanX:感谢楼上的回答 我的JOB TYOE确实是选opti to minimum 10/05 17:08
9F：→ gogomanX:可是这样他把H接上两个C 感觉不是不太合理吗? 10/05 17:09
10F：→ gogomanX:有办法要他做最佳化结构 但不加上额外键的指令吗? 10/05 17:10
11F：→ gogomanX:不最佳化的话算出来的HOMO和DIPOLE应该会跑掉吧@@ 10/05 17:10
12F：→ sexyrickysky:那个键节只是参考用的，电脑帮你判断出来可能会有键 10/05 17:28
13F：→ sexyrickysky:生成，不一定准确。所谓的键节不要单存想说只是某某 10/05 17:29
14F：→ sexyrickysky:原子与另外一个原子共用电子才会产生键节。 10/05 17:30
15F：→ sexyrickysky:举例来说，一般大家会认为氢原子轨域最多只能再接受 10/05 17:30
16F：→ sexyrickysky:一颗电子与其它原子形成共价键。但这只是过渡简化的 10/05 17:31
17F：→ sexyrickysky:价键理论倒出得到的结果。所谓的键节更精准的定义应 10/05 17:32
18F：→ sexyrickysky:考虑轨域的"混成"与重叠，你可以看看你的轨域图， 10/05 17:33
19F：→ sexyrickysky:那个氢原子的s轨域是不是同时与临进的两个碳原子轨域 10/05 17:34
20F：→ sexyrickysky:有混成的情况。 10/05 17:34
21F：→ sexyrickysky:要判断结构合不合理绝对不是用gaussian画出来的键节 10/05 17:35
22F：→ sexyrickysky:判断，再强调一次，那个只是方便我们人类做为参考， 10/05 17:35
23F：→ sexyrickysky:结构的合理性判断方式有几个最基本但好用的方法： 10/05 17:36
24F：→ sexyrickysky:使用频率分析确认，看看是否存在虚频。 10/05 17:36
25F：→ sexyrickysky:比较特定能量数值，看看是否与实验直接近。 10/05 17:37
26F：→ sexyrickysky:比较实验值与理论值的重要几何参数。 10/05 17:37
27F：→ sexyrickysky:不过这边要强调一点的是，gaussian在正常情况下都是 10/05 17:38
28F：→ sexyrickysky:假设分子在气态0k情形下作计算，所以要比较的话最好 10/05 17:38
29F：→ sexyrickysky:拿气态的资料比较。 10/05 17:38
30F：→ sexyrickysky:如果你发现跟你的实验结果差距很大，那表示可能产物 10/05 17:40
31F：→ sexyrickysky:存在多个稳定结构，你只找到其中一种。或是说，你的 10/05 17:40
32F：→ sexyrickysky:计算方法一开始就考虑得不周全所导致的错误。 10/05 17:41
33F：→ sexyrickysky:例如:level太低....等等 10/05 17:41