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做一点补充: 近几年来 无论国内国外 渐渐开始把生物资讯 改称为生物医学资讯 (e.g. Bioinformatics Institute --> Biomedical Informatics Institute) 细看这个名词可以发现 生物到医学 即是基础到临床 这个领域便是希望藉由资讯 技术 整合两个点为线 进而加速其发展 此版已此为名 当然也是希望更多在这条线上的人们 可以藉由这个版 凝聚不同领域的共识 创造互通互信的语言 更能找到为彼此连结的那条线 ※ 引述《huggie (huggie)》之铭言: : 政见 : 生物医学资讯是一个相对新兴、跨领域的学门。国内投入此领域已有数年, : 但也许是这个领域人数不多的缘故,缺乏专属沟通的平台。过去其实也曾经 : 有生物资讯专门论坛设立,但知道的人不多,参与的人更少。其实除了生医 : 资讯人以外,今日的生物人在研究中,也往往不脱广义的生物资讯的范畴。 : 何谓生物医学资讯?生物医学资讯是藉由资工、统计、数学、生化等来研究 : 生物以及医学的议题。在生物学方面,在三千多个物种的基因体定序完成的 : 今日,以及各种高通量实验资料的出现,对於进一步了解生物学提供了机会 : ,但也造成了分析上的困难。在医学方面,随着各种基础设施的建构,加速 : 了对於各种临床数据的蒐集,也希望能对这些资料进行分析,归纳出对於诊 : 断以及治疗有用的资讯。本质上似乎这是两个议题,但共同的是,希望藉由 : 跨领域的人才一起研究一堆看似杂乱无章的数据,提出进一步的假设。 : 生物资讯具体的分析在参考 Wikipedia 以及 Bioinformatics.org 之後, : 或许可以粗分成以下几类(概略的分法,各领域之间有不少重叠部份): : 序列分析/比较基因体学 (Comparative Genomics) : 基因注解 (Genome Annotation/Gene Finding) : 资讯演化生物学 (Compuational Evolutionary Biology) : 基因表现分析 (Analysis of Gene Expression) : 蛋白质表现分析 (Analysis of Protein Expression) : 功能性基因体研究 (Functional Genomics) : 蛋白质体学 (Proteomics) : 结构基因体学 (Structural Genomics) : 系统生物学 (Systems Biology) : 医学资讯则牵扯到基础建设的建立,例如蒐集并且处理资料,以及对这些资 : 料做进一步的推论。由於本人(huggie)对这方面不是非常的了解,因此先 : 且略过。有待於对医学资讯琢磨较深的板友来补充。 : 以上是较详细的定义,但广义的来说,任何藉由电脑来处理生物或医学资料 : 的方法即是生医资讯。举凡资料的存取、分析、以及预测,皆为生医资讯的 : 一种应用。因此,我想不只生医资讯人能受益於此板的讨论,也希望生物人 : 能多多利用这个平台,只要不是单纯 wet bench 实验上面的问题,牵扯到 : 工具方面的使用,就是本板的好问题。 : 因此,本板的讨论范围很广泛,暂分为以下几项: : 1. 工具 : 网路资源例如 NCBI、PDB 以及各式资料库,或者分析工具例如 BLAST、 : Sequest等,凡是在研究中所遇到的,工具上的使用皆为此类。 : 2. 程式 : 生物资讯传统上比较常用的程式为 Perl 与 Java ,但其他工具如 C, : Python 等使用的人也不少。凡程式方面,比较需要生物背景知识相关 : 的,例如相关套件使用(BioPerl,BioJava,BioPython 等),或者是 : 比较基础的程式问题皆规於此类。 : 3. 用语 : 由於是跨领域的学科,许多人背景另有专攻,刚接触这个领域时不免对 : 於一些简单的基本英文用字有不少障碍,看期刊颇有困难,普查字典也 : 不得其解(本人曾深感其苦,现在也尚未完全解脱)。希望生物背景较 : 扎实的板友能为初踏入此领域的人解惑。相对地,生物背景在接受资讯 : 方面的训练的时候或许也有类似困扰,也希望大家能倾囊相助。 : 4. 其他研究问题 : 各子领域都有其研究上面的问题,凡与生医资讯此大伞相关,dry lab : 实验的问题,都适用於此板。 : 5. 消息 : 监於生医资讯方面讨论的很少。本板除了作为一个问答的论坛以外,也 : 希望板友能提供最新的消息以及知识。不论消息来源是新闻,还是最近 : 发表的期刊,或者来自於研讨会的演讲,都可以提供消息,亦或可加入 : 一些个人看法以及心得,提昇讨论的风气,刺激板友新的想法与新做法 : 。希望本板能在论坛之外,作为一个蒐集新闻的平台。 : 6. 会议 : 若有相关的研讨会,课程以及讲习营等消息,只要是开放外界参加的, : 也希望大家提供给有兴趣的人知道。 : 因为个人背景的关系,以上讨论也不免偏好生资方面,希望有医资方面的人 : 才来一起参与。另外,本板原本是要由 realism 发起,无奈文章数不够, : 目前仍在冲文章数中,因此由本人代为发起。不过,我是真的才疏学浅(非 : 自谦),望能抛砖引玉,也希望大家能对於本板板务提供一些意见,谢谢! --



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◆ From: 140.129.77.166 ※ 编辑: realism 来自: 140.129.77.166 (05/30 19:18) HIbaby:转录至看板 BioMedInfo 05/31 11:08







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