作者lingon (林果)
看板BioMedInfo
标题Re: [转录]电脑辅助药物设计
时间Mon Jun 2 12:18:34 2008
※ 引述《realism ()》之铭言:
: 电脑辅助药物设计,基本上来说,可以分成四大块
: 1. 有作用目标(蛋白质 等等)的3D结构,也有已知与其作用的小分子,
: 而且可能有co-crystal的结构
: 2. 有作用目标的3D结构,但是不知道作用的小分子,
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: 或是想要从头开始设计,找出新的东西来(往往是因为专利问题)
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稍微comment一下, 在这种状况药厂常会以in silico screening 来screen
大型的chemical library找有可能的small molecule candidates,
找到这些candidate後会以HTS方式来证实然後交给chemists来作modification,
药厂的small molecule library 虽然巨大但diversity有限,
所以美国NIGMS有一个project 叫CMLD (Chemical Methodologiess & library Development)
来制造性质差异巨大的chemical compound library以及证实synthetic methodology的可用性.
(可免除computationalist要chemist凭空做一个没有被做过的compound, 然後无效的糗境)
: 3. 没有作用目标的3D结构,但是知道有对这目标有作用的小分子
: 4. 没有作用目标的3D结构,也没有小分子
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