作者huggie (huggie)
看板BioMedInfo
标题[问题] 基因数目
时间Thu Jun 5 19:51:34 2008
请问现在认知的人类基因数目个要从哪边找?
我只查到这个...不过这是2004年的东西了
http://www.nature.com/nature/journal/v431/n7011/full/431915a.html
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◆ From: 140.129.160.62
2F：→ huggie:ensembl 是不是哪边也找得到资料? 06/05 20:24
4F：→ auymle:但这些报导都focus在protein-coding genes 06/05 20:54
5F：→ auymle:其实还有很多noncoding gene还没被发现 06/05 20:55
6F：→ huggie:原来 RNA 那些定义也算 genes? 06/05 21:09
7F：→ huggie:我刚1F panther pie chart 那个是 reviewed refseq,选 all 06/05 21:09
8F：→ huggie:数目是 25431 06/05 21:10
9F：→ huggie:auymle这篇不错...至少有个reference. =) 06/05 21:11
10F：推 nightcatman:small RNA算基因啊 而且大部份都扮演调控的重要角色 06/05 21:12
11F：→ huggie:了解 06/05 21:12
12F：→ windincloud:夜猫大 照你这样说 siRNA miRNA也是基因? 应该不是吧~ 06/05 21:40
13F：→ windincloud:基因通常我们指的是functional gene吧 :P 06/05 21:41
14F：推 auymle:miRNA当然也是gene 他们也有function 06/05 21:46
15F：→ auymle:注意喔 siRNA指的是外生性的small RNA, 他不是生物体 06/05 21:48
16F：→ auymle:自己产生的, 而是外来的 06/05 21:48
17F：→ windincloud:哈 我了解我误会在哪了~ 拍谢 我以为这边要问的gene是 06/05 22:05
18F：→ windincloud:model 所以才会说miRNA siRNA 非基因 XD 06/05 22:06
19F：→ windincloud:^ gene model 少打 06/05 22:07
20F：→ huggie:我知道miRNA有功能，但是我不晓得他们也定义为 "gene" 06/05 22:08
21F：→ huggie:虽然常常听到 "no-coding RNA" 06/05 22:09
22F：推 Goldexp:现在已经发现endo-siRNA罗 06/05 22:29
23F：→ Goldexp:会从transposon, long hairpin和cis-NAT region产生 06/05 22:30
24F：→ huggie:endo-siRNA? 我一直以为 siRNA 跟 miRNA 结构一样呢.. 06/05 22:53
25F：推 Goldexp:endo-siRNA 是21nt miRNA长度就较不一定 06/05 23:22
26F：推 auymle:应该不是这样定义的吧?? 06/05 23:28
27F：→ Goldexp:endo-siRNA会被hen1 modify miRNA没这样现象(in animal) 06/05 23:28
28F：→ Goldexp:不是这样定义没错 这只是从deep-sequencing观察到的差别 06/05 23:30