作者windincloud (云淡风轻)
看板BioMedInfo
标题Re: [问题] 资料库中要用哪一股是怎麽定义?
时间Wed Jun 17 12:42:10 2009
※ 引述《adu (^_^)》之铭言:
: 想请教版大们,
: 由於我现在在处理一些资料,有牵扯到互补双股的问题
^^^^^^^^^^^^
哪样的资料? 从哪边取得?
: 由於 A <-> G C <-> T
^^^^^^^^^^^^^^^^^
这边你指的是? 要将序列转互补嘛?
那这样应该是 A <-> T C <-> G吧~
若不是的话 那请不要写 <-> 会让人起误会地~
: 所以AC的特性会类似GT是可以理解的
: 但是又发现AT的数量远大於GC,变得很多资料都没办法解释
^^^^^^^^^^^^^^^^
这边要看特性吧~ 通常是编码区GC高 非编码区不一定
: 想请教版大,把哪一股丢上NCBI有没有特别的定义呢?
所有资料都是5'写至3'
所以当你要丢资料请先确定序列是由5'写至3'
至於互补不互补 BLAST 会帮忙判定的~
: 谢谢版大的回答Orz
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