作者adu (^_^)
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标题Re: [问题] 资料库中要用哪一股是怎麽定义?
时间Wed Jun 17 13:53:23 2009
※ 引述《windincloud (云淡风轻)》之铭言:
: ※ 引述《adu (^_^)》之铭言:
: : 想请教版大们,
: : 由於我现在在处理一些资料,有牵扯到互补双股的问题
: ^^^^^^^^^^^^
: 哪样的资料? 从哪边取得?
NCBI 人类的genome
: : 由於 A <-> G C <-> T
: ^^^^^^^^^^^^^^^^^
: 这边你指的是? 要将序列转互补嘛?
: 那这样应该是 A <-> T C <-> G吧~
: 若不是的话 那请不要写 <-> 会让人起误会地~
对~是只互补的意思:)
: : 所以AC的特性会类似GT是可以理解的
: : 但是又发现AT的数量远大於GC,变得很多资料都没办法解释
: ^^^^^^^^^^^^^^^^
: 这边要看特性吧~ 通常是编码区GC高 非编码区不一定
: : 想请教版大,把哪一股丢上NCBI有没有特别的定义呢?
: 所有资料都是5'写至3'
: 所以当你要丢资料请先确定序列是由5'写至3'
: 至於互补不互补 BLAST 会帮忙判定的~
还是没有很了解
即便都是5'写到3' DNA以双股的方式存在,那究竟会挑哪一股出来表示?
如
http://bioinfo.cs.ccu.edu.tw/wiki/doku.php?id=transcription
是挑识别股还是模板股?
又以genome的资料来说,不同基因,被转录的可能会是双股中其中一股?
那在这样的情况下,又会挑哪一股上传到资料库呢?
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