※ [本文转录自 Biology 看板 #1ElGKTNg ] 作者: sysbio2011 (苹果的滋味) 看板: Biology 标题: "用电脑玩生物学"讨论小组，诚徵同好 时间: Fri Nov 11 19:20:59 2011 大家好， 我们是一个草创的业余读书小组，不是正式的学术单位， 希望利用业余时间，来研究、讨论有趣的生物现象。 在这里想要邀请对以下题目有兴趣的学生或是研究人员， 一起透过网路，或是实体聚会来参加讨论。 近年来，有许多利用电脑软体来模拟生物动态现象的软体。 我们目前计划要玩的题目，有两大主轴： (1) 计算神经生理 由离子通道的开关调控，到单细胞的电生理讯号模拟，突触的传递， 到简单神经网路的模拟。 目前选择以 NEURON 这个软体来模拟。这是 freeware，可自由下载。 网站： http://neuron.duke.edu/ (2) 系统生物学 了解生化反应如何调控生化讯号的传递，包含蛋白质的反应和基因的调控。 目前选择由下列两个软体开始玩。 CellDesigner http://www.celldesigner.org/ 和 SBW 软体 http://sbw.kgi.edu/research/sbwintro.htm 讨论的方式是： * 每月在台北聚会一次，内容包括文献阅读分享，软体模拟 demo。 * 平时透过网站和 email 讨论。 讨论的原则，希望是 * 由浅入深，尽量由大一大二程度可了解的基本知识出发。 * 可由电脑模拟，呈现的问题。 * 讨论已有实验 data，或可能可以由实验验证的问题。 我们目前的成员至少包括三位 PhD，研究专长分别为神经电生理， 粒子物理，和基因生物资讯。虽然目前各有正式工作，但基於业余 兴趣，想要来学习、研究，如何"用电脑玩生物学"。我们对这些 软体也属外行，但相信根据背景知识和兴趣，也可以玩出兴趣。 欢迎对这题目有兴趣，具高度自学和分享热忱的同学或是业余爱好者， 莅临讨论指导，一起分享学习心得。 欢迎加入讨论群组 (须登入) https://groups.google.com/group/sysbio2011 最近一次聚会，预计在 2011/11/19 下午 2:30，在台北，地点待定。 主题：(1) 酵素作用的基本原理 阅读资料 Lehninger, Principles of Biochemistry (5th ed), Chap. 6 Enymes (2) 以 CellDesigner 来模拟简单的 chemical kinetics. 有任何问题，或有兴趣参加的朋友， 请写信给 starynight68 <at> googlemail.com 吉本氏 我可以透过 email 提供讲义。 Have fun. --

※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc) ◆ From: 114.24.120.33 ※ sysbio2011:转录至看板 Chemistry 11/11 19:21 ※ sysbio2011:转录至看板 Physics 11/11 19:21

※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc) ※ 转录者: windincloud (140.109.183.89), 时间: 11/14/2011 16:05:52