BioEdit 的使用相当简单 (如果你只是单纯画画 paper 上的演化树，那更简单) 极其简化版本解说如下： 1. 拿到序列 取得你要分析的序列 (哪个资料库随便你) 你可以用复制贴上的、用其他档案汇入的 (txt, excel etc.) 或是用最方便的，利用网路直接用 GI 或是 accession number 从 NCBI 抓回来。 要比那些比几条，蛋白质还是基因，都给他先抓好。 2. 修修改改 看你的序列是不是需要修改的，有些人只比较某一段，比方说只比某一个 homolog 的区域，比一个 domain 之类的。或是某些蛋白质你抓他来是比基因，但是他还有其 他不是该蛋白质的基因片段在里面等问题，就利用其内剪剪贴贴的功能修到你满意为止。 3. 做 ClustalW multiple alignment 选择 Accessory Application 中的 ClustalW multiple alignment。(全使用预设值) Alignment 的原理跟方法我不在此多谈，总之就是把你要比较的序列方在一起比较， 要先比较才能画接下来的演化树。 (简单来说在此步骤会将类似之序列对整齐) 4. 画演化树 (Neighbor) 演化树要怎麽画，有很多理论跟方法，在这里先使用比较常用的 neighbor joining 这是 Saitou 和 Nei 在 1987 年提出来的 (有兴趣用 neighbor joining 当关键字 ，可以找到原始 paper 与相当多解释的资料，在此不谈。) 选择 Accessory Application 中的 neighbor phylogenetic tree。 要比对的是 DNA 就选 DNADist 的 要比对的是蛋白质就选 Protdist 的 就这样子就画好了，不过有点不好看，没关系，把档案存出来再用 TreeView 来开， 就可以修改成你喜欢的样子了 (paper 的样子??) TreeView 下载点： http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treeview.html ※ 引述《Luciel (路西艾尔)》之铭言： : 请问怎麽用BioEdit画演化树呢?....如果要分析的话... : 有那些文章可以看呢?.... 上述是超简化速成版，如果你要去分析数据，建议将基本理论紮紮实实的弄懂， 哪些文章可以看？建议找各理论原始论文来看一下比较好。若是时间不够， 有许多讲分析方法的 review 文章，很容易可以找到，看你做的生物是什麽而定。 : 因为只有学过演化树简单原理....所以也看不太懂演化树阿.... : NCBI有麽?....最好是中文的啦....看起来快一点.... : 感谢各位大大..... 中文的东西很少，英文资源比较多，看英文到最後会比中文还快。 --

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