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标 题请问cloning问题
发信站中央大学松涛风情资讯站 (Sun Sep 9 12:12:00 2007)
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最近在做一个cloning,做了一个多月已经想不出别的办法了,特来求教
vector length: 4.1kb (pAcGFP1-1)
insert length: 2.9kb
(PCR product as with restriction site at both ends, and several bp extension)
利用sticky end(HindIII & SacII)做为insert接入vector的切位
在ligation之前,先各以Phenol/Chloroform/Isoamyl alcohol(以下简称PCI)纯化
做完double digest(两个RE都是Promega的)之後直接跑胶做gel extraction
然後就测定浓度并做ligation(by Promega T4 DNA ligase)
曾经测试过的ligation reaction condition包括:
4℃ overnight、16℃ overnight、Room Temp. for 2hrs and 4℃ or 16℃ overnight、
Room Temp. overnight(以上皆为代理Promega的劲因公司提供的建议)
曾经试过的vector:insert molar ratio包括2:1、1:1、1:2、1:3
(total DNA控制在不到100ng)
(附注:後来拿ligation产物跑电泳,皆发现一块大於10kb的smear区域,
光拿pAcGFP1-1跑不出这种长度)
曾经使用过的competent cell包括益生的ECOS101及
(每个reaction皆将所有ligation product全部加入一管competent cell中)
Stratagene的XL-10 Gold ultracompetent cell
(每个reaction取20ug competent cell,加入1ul的ligation product)
(由於这型competent cell对加热温度及时间较为注重,
故而前段icebath及heatshock的部分放在0.2ml PCR tube内进行,
之後incubation再转移到1.5ml eppendorf tube中并加入培养液)
在LB agar plate上使用的抗生素及浓度为Kanamycin 50ug/ml
这样子做了好几次都做不出来
请问有做过这个质体cloning的先进或是做过这麽长cloning的先进
我还有哪些实验细节可以改进的,谢谢
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