作者blence ( )
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标题Re: [问题] 伪基因
时间Fri Sep 21 00:29:17 2012
乱入一下讨论基因剪接的机制,顺便赚P币
在不讨论transposone之类等藉由特殊序列剔除DNA片段的情况下
已经有人提到DSBR剪除伪基因的可能性
包括是VDJ end-joining(NHEJ)或homologous recombination(HR)两种
不过依照目前的研究并没有证据显示这两种可以针对特定序列
因此要认定DSBR启动伪基因的剪除
不如先探讨那些DNA片段上是否隐藏特定endonuclease辨识的序列比较可行
除此之外,似乎只有在伪基因两侧自发性的(非可预期)的双股断裂
才有可能引发DSBR移除伪基因
假使上述板友接受这个说法
那就没有DSBR或基因剪除机制会有造成细胞能量的问题
毕竟这套机制不只是会剪来剪去
而是为了更重要的是目的--也就是维持基因体稳定
另外对於板友讨论的我也有两个部分感兴趣
像是以细菌的角度来解释只要第一代恰巧剪除伪基因就有利於第二代的可能性时
依照我对於DSBR的观点
以及推测DNA双股断裂的位置可能呈现常态分布
那麽如果某细胞能恰巧剪除不需要的基因或伪基因时
不就表示暗示有太多其他的细胞比较衰尾剪到不该剪的?
这样好像是买彩券中大奖就能富两代一样
可是万一没中奖呢?会不会反而让伪基因出现?
不过还是说这个观点是建立在并不存在专一的伪基因剪除机制的假设下
第二个感兴趣的则是伪基因的chromosome structure特徵
一般对於基因的观念是越容易表现的地方histone包覆越松散
这牵涉到GC content、histone modification与binding protein的调控
因此既使伪基因曾经能活化表现过
但是在伪化持续不表现之後,想必包覆的histone会越来越难打开
那麽想要求这些紧闭的DNA片段产生DNA双股断裂并剪除此处伪基因
我想应该会比剪除一般正常表现的基因稍难吧
另外再补充遗传的观点,虽然这一类的例子不是那麽贴切
有些hereditary syndrome是来自proximal promoter region mutation or deletion
我觉得这种情况似乎能引伸到"伪基因的剪除机制"不全是有利於後代
万一剪到不该剪的位置
不仅仅无法真正消除伪基因
还可能把正常的基因给伪基因化了
※ 引述《Onagraceae (Epilobium)》之铭言:
: 感谢s大的文章提醒
: 我才瞬间发现p大说的能量消耗不是指单纯的突变
: 而是修剪机制
: 不过即使真的有办法演化出来剪伪基因的酵素/机制,而且可以非常有效辨识伪基因
: 我们也得想想下列问题
: 1)合成这个酵素/机制所花的能量,是否能大过因为伪基因带来的能量耗损
: 2)即使真的大过伪基因带来的能量耗损,当伪基因被愈切愈少时,
: 伪基因带来的能量耗损也会变少,最终依然变成浪费能量去合成那些酵素/机制
: 3)一旦所有的伪基因被切除乾净,这个剪伪基因的酵素/机制也瞬间无用了
: 这时他虽可转出蛋白质,但毫无作用,十足是个「准」伪基因
: 最後这个机制也会因为变异的累积,成为新一代的伪基因
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