作者over999 (唉呦)
看板Biology
标题[问题] Sub-cellular localization网站
时间Tue Nov 15 20:40:54 2016
请问我想找关於基因表现出的蛋白
在细胞中的位置 除了GeneCards和 Human protein Atlas之外 有更好的网站有标出Sub-c
ellular localization吗
谢谢!
BTW 我还想问
Metacore/IPA等大资料库中的Subcellular 是准的吗 有些基因在网站跟软体中写的位置
不太一样欸
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※ 编辑: over999 (101.12.135.167), 11/15/2016 20:50:20
1F：→ blence: 会这样问是因为你不相信genecards与protein atlas吗?11/15 21:43
主要是因为Atlas资讯很模糊 只会显示 核/胞内/膜/胞外 有些膜蛋白我没办法看出来是
内膜蛋白还是穿膜/外膜蛋白
GeneCards则是用评估值
膜5分/质4分/骨架5分/核3分
有时候遇到膜 核都五分 就不知道是核膜还是细胞膜
所以我现在都是结合网站及软体 再找paper 但是我的基因数量有点多 想说有没有比较有
效率的方式
※ 编辑: over999 (101.12.135.167), 11/16/2016 09:28:18
※ 编辑: over999 (101.12.135.167), 11/16/2016 09:30:10
2F：推 lelojack: GO enrichment分析是你最简单的解 11/16 23:07
3F：→ Ianthegood: kegg IPA基本上就是人家帮你念过paper啊 自己确认吧 11/18 03:51