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发信站Your Organization (Tue Aug 29 08:24:10 2000)
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超级电脑「基因配对机」 破解密码最「内行」
本报系专用纽约时报特稿 前一阵子因人类基因图谱初稿公开,而声名大噪
的美国瑟雷拉公司,最近买下华裔电脑专家余光义博士设计的超级电脑「基因
配对机」。
如果有人问「帕拉塞尔」(Paracel)公司华裔总裁余光义博士,采买该公
司特别设计的超级电脑是那些政府单位,他一律含糊其词,只说是联邦政府。
然而,六月份斥资两亿五千万美元买下帕拉塞尔的「瑟雷拉」公司总裁文特
可不那麽迂回慎重,他说,帕拉塞尔的机器是卖给国安局的,专门用来渗透别
的国家,破解密码。
帕拉塞尔的电脑,特别适用於由文件中筛选特殊字眼、词汇或是字串,但是
,帕拉塞尔电脑科技还可以用来破解另种密码-基因密码。因为据余博士说,
基因序列与文字「都是字串」。
生物资讯学要处理的资料量如此庞大,一般电脑碰到时只能求饶。科学家为
研究一组特殊的去氧核醣核酸(DNA)序列,可能得找遍整个人类以及其他
动物、细菌的基因库,来寻找类似的序列,而新的基因资料公布後,各公司必
须尽快分析,率先发现,才能保住智慧财产权。因此,帕拉塞尔电脑科技因而
变得很醒目。
电脑每十八个月便加快一倍,但是基因资料成长得更快速,例如公立的去氧
核醣核酸序列资料库「基因银行」(GenBank)最近六个月内,便把资讯量增加
到八十六亿件以上,成长不止一倍。
IBM估计,到二○○二年以前,生命科学领域的电脑软硬体商机会成长到
卅五亿美元。为此,「昇阳微系统」与「康柏」两家电脑科技大厂也投入研发
相关产品,如超级电脑与伺服器等。
然而,帕拉塞尔的电脑「基因配对机」(Ge neMatcher)是专为基因组研究
者设计的。该机器使用七千枚处理器,排列的方式最适合把字串比对出来。成
长於香港、台湾及马来西亚,拥有加州理工学院电脑博士学位的余光义把这种
处理方式比拟为序列里的每个字母在一条橡皮水管里流动,要研究的资料就好
像水流经水管,字母流动频率为每秒钟三千万个,各个处理负责检查每个流过
的字母是否符合配对条件。
基因配对机并不便宜,定价每台卅六万美元,然而余博士说,就设计的目的
而言,它比配备「奔腾」(Pentium)中央处理器的电脑,快上一千倍,所以
很划算。