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标 题Re: 请问要去哪抓所有人类蛋白质序列的资料呢?
发信站生生不息 (Sun Apr 16 03:49:32 2006)
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※ 引述《ubiquitin (幸福金金幸福)》之铭言:
> 我想抓所有蛋白质序列来分析
> 之前有试过以 swiss prot 连结 UniProt
> http://www.expasy.uniprot.org/database/download.shtml
> 但是抓下来的fasta 档案似乎是所有生物的
> 我用手提电脑跑 perl 写的程式
> 结果记忆体不够....
> 所以想先抓所有人类的蛋白 fasta 档就好
> 只要人类蛋白的
> 叙列名称和氨基酸序列
> 请问众大大们
> 要去去哪抓呢?
同一个网页,
画面的左侧有一个联结可以通向UniProtKB的ftp
ftp://ftp.expasy.org/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/
进去以後选taxonomic_divisions资料夹
在里面就有uniprot_sprot_human.dat.gz跟uniprot_trembl_human.dat.gz
两个档案,可以自行选择需要的档案
希望有帮到你..
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