作者jaycao (风一吹特别冷)
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标题Re: [问题] RNAlater
时间Wed Apr 26 23:53:16 2006
※ 引述《hita (JIN)》之铭言:
: 想要请问抽RNA的先进
: 请问细胞收下来之後 要马上就抽RNA 或是有什麽办法能保存?
: 因为有时候要收时间点 想要全部收完再一次抽RNA 转cDNA
: 加RNAlater冰 4度C http://www.ambion.com/techlib/prot/bp_7020.pdf ?
: 或是加了Trizol之後 冰-80!?
加Trizol裂细胞之後,-80度可以保存几周没问题
: 再加Trizol之前 我细胞是要先加入少量PBS(一般细胞用 无RNase-free)打散
: 还是可以先离心呈pellet状後 去上清 再加入Trizol打散
: 怎麽样做比较好!?
应该没需要吧
我都是
把培养基吸掉,PBS洗一下,弃去
然後直接把Trizol加到培养皿里
莫非你抽的是悬浮细胞?
: 那抽完RNA转成cDNA後
: 要如何去订cDNA浓度 测OD!?
没法的啦,定量是在做RT之前
: 因为一直抽不好
: 我抽完RNA 测OD 260/280都有1.8以上
基本正常阿
和你用的溶解RNA的水有关系
小于1.65才不对
: 然後跑胶
: (没有用特定的RNA gel, 只是用1% agar gel, 100mV, 8mins, 糊掉,
: 没有18S.28S分明的band)
其实不需要RNase free的胶,把电泳槽洗洗干净,换新的电泳液就可以了
除非你刚跑过大抽质粒的电泳,那会带入很多RNase
(我师妹就干过这种事,抽出RNA跑电泳看,说全降解了,我看了一眼,槽很脏,
而且竟然用的回收重融的胶,新配一块再跑一次就OK了)
我一般都用100V,跑15-20min,你的电压不会太小?时间不会太短?
另外,5S有看到吗?
如果是都降解掉了,5S那会一大陀
: 但还是硬着头皮坐下去 取1ug的RNA 加DNase 然後再RT转成cDNA
: 转完测OD 值都差不多 1ug~1.5ug (但里面含有enzyme buffer...这个值不可信吧!?)
好像这一步没人测OD的吧
: 然後PCR 使用GAPDH primer(约200bp) 35cycle 都有出来
GAPDH应该很容易拉出来才对,顶多25循环就饱和了,35cycle应该暴掉了
: 但P我自己基因的一般PCR primer(约500bp) 有的有 有的没有(应该是要P到的)
: 有加positive control 是OK的
: 我主要的目的是要做real time PCR
: 但在抽RNA品质那麽不一糟糕的状况下 实在不知道data.........@@
: 所以想要请问先进们的经验
: 或是有什麽资料我可以去阅读的 麻烦大家指点 谢谢 :>
如果有问题还是抽RNA的时候吧
仔细再看看Trizol的说明书
抽RNA的时候都要用RNase free的或是DEPC处理过的试剂、枪头
另外一直要带手套和口罩,手是RNase最大来源
还有不要用vortex,那样打断长的转录本
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