作者aggaci (有气质的台客)
看板Biotech
标题Re: 请问关於EMSA的问题
时间Mon May 29 01:12:12 2006
※ 引述《indie (band of brothers)》之铭言:
: ※ 引述《aggaci (有气质的台客)》之铭言:
: : 再请问您一下
: : 请问您的mixture要loading时,有加dye吗?
: : 因为我不只在一个地方看到不加dye loading
: : 於另一个well只加dye以便看跑到什麽地方...
: : 为什麽呢?
: 我最近跑的感觉是加了dye以後
: protein会沉淀 并且卡在well里面 (可以看到明显的particle)
: 所以有在考虑不加dye loading
: 可是我很怀疑 不加dye loading
: DNA会不会沉不下去?
: 我用的是polyacrylamide 的胶 (直立式电泳槽)
: 不知道有没有先进有load过不加dye的DNA呢??
: 可以跑吗?
欧! 这个我这几天有做
的确,在well里的抗数比之前少许多
可以沉下去啦,安啦
指不过有个风险是很怕load错,毕竟没颜色
不过今天跑出个奇怪的DATA
昨天重新label我的probe
想说来测试看看
过gil filtration後,抗数超强(超过2000抗)
binding完要loading前,每一管抗数大概300抗
结果跑了5%的PAGE(含0.5x TBE)後,free probe怎麽只有10抗??!
(第二个DYE没跳海阿)
真是怪了,难道说label的效率极差妈???!!
以下是我 label的步骤
double strand DNA (sticked end,5端各突出4个T) 1.5 ul(final 1 pmol)
10x buffer 3 ul
klenow enzyme(NEB) 1.5 ul
p32-ATP 3.75 ul
water 18.75 ul
total 30 ul
37度作用2小时再过gel filtration column.
真是怪了............囧oz
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