你好呀 谢谢你的回答^^ 所以同种颜色是同样"物种分类"吗 可是不知道同样分类指的是再哪一个层次相同呢? (ex:界门纲目科属种..) 似乎不是"同种" 因为我自己做query的结果 有不同物种 但颜色仍是相同 不过隶属於同一目 另外想请问 你有提到相似程度可由branch length 来看 但在tree上的距离多近代表他们具有一定相似程度 或者是说 有没有一个依据 让我们知道在tree上怎麽样的距离 代表序列上怎麽样的相似程度呢 谢谢你 ※ 引述《mengyichen (死小胖)》之铭言： : ※ 引述《hikarujun (Hikaru)》之铭言： : : 大家好 : : 我用BLAST比对序列间的差异 : : 然後检视其phylogenetic tree : : tree上的每个节点有不同的颜色 : : 请问实际代表的意义是什麽呢 : 我点了Tree view网页上方Sequence Label旁的问号来看(不用真的点，游标放在上面即可) : 有一句话这麽说 : The color of the leaf node indicates the Blast Name of the sequence. : 於是我就在下方选单选了「Sequence ID (Blast Name)」 : 我用的query sequence是2894208(GI number) : 是Mycobacterium tuberculosis这种细菌中预测的蛋白质 : 我发现蓝色的节点都一样是细菌的蛋白质 : 而绿色的节点则是病毒的蛋白质 : 所以我猜应该是用来标示序列来源的「物种」分类 : : 我猜可能是跟相似程度有关 : 不是，相似程度可由branch length 来看 : : 但不同的颜色分别代表什麽样的意义呢 : : 我查过说明文件和上网搜寻 但都没有找到 : : 希望知道的版友能喂我解惑 谢谢 : 不用客气，这个功能若不是因为你的问题，否则我也不会注意到 : 其实每隔一阵子，NCBI都会将它的网页功能推陈出新 : 像这个功能我就觉得真的蛮好用的，如果不是要做严格的亲缘分析的话 : 可以省掉整理dataset的麻烦 -- 我当然书写自己必须说出来的唯一一回事 该如何面对我的时代、我的生命里的难题 http://www.wretch.cc/blog/hikarujun --

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