作者rpr (Cathy)
看板Biotech
标题Re: [问题] quantitative/semi-quantitative RT-PCR
时间Wed Jul 12 20:27:42 2006
※ 引述《aggaci (有气质的台客)》之铭言:
: ※ 引述《CErline (草螟仔弄鸡公)》之铭言:
: : 这样解释不知道对不对……
: : PCR 要定量不是只跑胶看它的亮度,
: : 应该要一起跑一个 house keeping gene然後再去比copy number
: : 如果只是跑个胶让 a和 b两个 band比表现量,大概都只能算半定量……
: 不对
: semi-quantitative RT-PCR 是必须将已知浓度的template等倍数稀释
: 分别去跑PCR,依照强弱作出一条检量线
: 再以内差法算出未知样品的量
: 但是说的倒简单,PCR有saturation的问题
: semi-quantitative RT-PCR仍然没办法解决,所以很少人用此方法
恐怕刚好跟你说的相反喔~
绝对定量(absolute quantitation)要先用已知浓度的相同东西做出一条standard curve
(如果要测total RNA,就用已知浓度的total RNA做standard curve)
利用内插法求你的sample浓度
当然,PCR本身的一些细节条件如saturation的事情就不在这里讨论
至於半定量(semi-quantitation)则是利用一个大家都有,而且量差不多的东西
(像是house keeping gene)当作分母一样的东西
在相同反应条件下,每一个sample都跟分母比後再做比较
你如果要问quantitative PCR,不知道是不是要问real-time quantitative PCR?
如果是的话,基本上它也分成absolute/semi quantitative
只是侦测的方式跟传统run gel的方式不一样,
它可以侦测到PCR的gerometric phase,这是PCR当中最符合y=2^n的时期
所以可以避开saturation的问题
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 163.15.174.204
1F:推 mandible:我也觉得是相反!! 07/12 22:20
2F:推 aggaci:谢谢哩~ 07/13 01:09
3F:推 CErline:原来如此啊…谢谢 07/13 14:03
4F:推 jbking:推 观念正确 07/20 11:30