作者mikoyan (mikoyan)
看板Biotech
标题Re: [问题] 新手问 Real Time-PCR ~
时间Sun Jul 30 18:59:18 2006
※ 引述《huangsw (Orz)》之铭言:
: ※ 引述《mikoyan (mikoyan)》之铭言ꄊ: 1.
: 30-40 cycle才过Ct
: 代表你的sample 是low copy number
: 简单的说 target DNA浓度不高
: 所以primer 没有很快的 进行PCR cycle 大量复制出DNA
: 想要快速达到Ct值可以试着增加DNA浓度
: 举例来说 mtDNA为检体时
: 萤光讯号很快就可以超越Ct...
: 因为mtDNA有母系遗传 以及HIGH copy number的特性
: 2.
: 我知道的SYBR... 里面没有Quencher dye耶...
: 会用到Quencher-Repoter dye probe的是 Taqman SNP assay
我们用的是 Master Mix (我在 ABI 的网站上没有看到这一项商品)
助教解释里面有 SYBR I Green, buffer, Taq, nucleic acid
我对照助教提供的成分和 ABI 公布的商品细项
我觉得 Master Mix 比较像是 ABI 上卖的 TaqMAN kit.. o.Oa
我个人猜想应该是有使用 Quencher-Reporter Dye Probes
只是助教没有详细说明使用材料
不然这就和我先前所读的原理不一样了 呵呵~
: 我知道 Ct 界线下 会有萤光没错...
: 但是那只是因为前十几次PCR产生短片段双股DNA所出现的萤光讯号
: 要到十几个Cycle後(前面先复制了一堆template)
: 每次PCR产物皆以 log 方式增加
: 萤光才会跟着上升 越过Ct.....
: 当你的DNA浓度低 所含的Target DNA也比较少
: 所以需要比较多的Cycle才可以让复制呈现 log 方式上升
那些 Ct 以下的讯号 有些会成为以 Log 倍数成长代表性讯号
我想这些讯号是我们要的....
而那些不会有 Ct, 不有後续 Log 成长的讯号呢 ?
我感觉这样的讯号挺多的耶....
这些讯号是不是反应中产生过多的 templates
而其中只有几个 templates 才会接续 replication, 才有机会可以 Log 成长
而那些没被选中的, 就是那些杂讯呢 ?
: 我在1.已经有说建议的方法 当然 不只那个方法啦......
: 以上是我对Real-time的了解....
我实习的设备也是 ABI 7900HT ~
这是我第一次做的 Real-Tiem PCR ! 多谢您的指导......... Orz
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◆ From: 218.169.102.42
1F:推 pcboy:ABI有 Master Mix 07/31 18:10