作者LuLowDa (...)
看板Biotech
标题Re: [问题]有关MSP-如何明确知道promoter的范围
时间Wed Aug 2 16:06:01 2006
※ 引述《dropdred (keep the faith)》之铭言：
: 在做MSP(Methylation Specific PCR)侦测promoter region中CpG island甲基化的状态
: 不是要先知道promoter的位置，然後再选取特定的范围来侦测CpG island甲基化的程度，
: 想请问：如何知道欲研究的基因的promoter region是从哪里到哪里？该如何界定？
: 能提供我如何查资料的方法嘛？
: 谢谢!!
http://genome-www6.stanford.edu/cgi-bin/Traser/traser
这是一个寻找Gene promoter的网站
先去NCBI上查你要找寻的基因的Gene ID
在那块输入ID的地方输入後，再设定你要它输出的东西
例如：可以设定它输出promoter的长度（预设为1000 bp）
还有建议你可以选promoter + exon 1的选项
因为有时exon 1也有调控基因表现的重要CpG island存在
若基因有alternative splicing的现象，
要注意其promoter是不是用不同的来驱动表现...等等
大概就这样吧 祝实验顺利！
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