作者dropdred (keep the faith)
看板Biotech
标题Re: [问题]有关MSP-如何明确知道promoter的范围
时间Thu Aug 3 14:53:04 2006
※ 引述《LuLowDa (...)》之铭言:
: ※ 引述《dropdred (keep the faith)》之铭言:
: : 在做MSP(Methylation Specific PCR)侦测promoter region中CpG island甲基化的状态
: : 不是要先知道promoter的位置,然後再选取特定的范围来侦测CpG island甲基化的程度,
: : 想请问:如何知道欲研究的基因的promoter region是从哪里到哪里?该如何界定?
: : 能提供我如何查资料的方法嘛?
: : 谢谢!!
: http://genome-www6.stanford.edu/cgi-bin/Traser/traser
: 这是一个寻找Gene promoter的网站
: 先去NCBI上查你要找寻的基因的Gene ID
: 在那块输入ID的地方输入後,再设定你要它输出的东西
: 例如:可以设定它输出promoter的长度(预设为1000 bp)
: 还有建议你可以选promoter + exon 1的选项
: 因为有时exon 1也有调控基因表现的重要CpG island存在
: 若基因有alternative splicing的现象,
: 要注意其promoter是不是用不同的来驱动表现...等等
: 大概就这样吧 祝实验顺利!
非常感谢你的回答,
但是我想更确切的知道基因的promoter...
不单只是序列,
所以想先知道有没有哪里有汇整各基因的promoter这种资料库
还是只能透过文献搜寻来定义基因的promoter区域
在这方面知道的很少,
所以任何的建议或提醒都非常的感谢各位
再次感谢大家!!
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