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标 题Re: [问题] 有关序列分析, 要用到生资概念......
发信站生生不息 (Thu Aug 17 11:18:27 2006)
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※ 引述《[email protected] (陶波湖上舞烟波)》之铭言:
> ※ 引述《malate (陶波湖上舞烟波)》之铭言:
> : 我手上有一个基因完整的蛋白质序列
> : 其中有几个胺基酸构成一个motif
> : 此种motif在这一个片段中重复了数次
> : 我想找其他生物的各类基因中是否也有此类似的情况发生(motif序列相似的情况下)
> : 各位大大知道有哪几个平台可以做这样的分析吗
> 有试过
> 找出相似基因後
> 想看这些基因中是否也有相似的片段且重复出现
> 但相似度最高才60几 且只出现在一个位置
> 这样是没结果 还是我用错方法了
> 还有
> 谢谢大家帮我解答 感激不尽~~
推荐一种方法....
自己写程式抓出所有含有该motif
用程式语言Perl
安装PERL 免钱
参考书 Begining Perl for Bioinformatics갊躨ケ茖潃礼拜ꔊi以自己写程式抓出所有含有该motif 之蛋白质
更快的方法:
找个做生资的人帮你写程式
不用几个小时
--
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ubiquitin 从 leu.ibms.sinica.edu.tw 发表