作者melodyrabbit (melody)
看板Biotech
标题Re: [问题] 我的insert切不下来
时间Wed Aug 23 02:03:39 2006
※ 引述《CloudTear (照片能吃吗?口去~)》之铭言:
: 不好意思,请高手帮帮我
: 1.就是我的目标基因 (insert,约400bp),接上T-A Vector,
: 送入E .coil中transform放大之後,
: 无法从T-A Vector 上切下来,
: 就无法把insert送去构筑在我所想构筑的另一个Vector上。
: 我是这样做的:
: 有接inesrt(400bp)的T-A vector mini 取10λ
: ↓
你的DNA浓度呢?
只取10ul的话,很可能它是有切下来的,只是切出来的band太淡了看不到
而且之後去ligation的话insert也需要多一点阿
: 用Sma I 切(25度,4hr) total:30λ
: ↓
: 做失活(80度,20min)
: 沈淀(total加到200λ,用phenol/chloroform,再用carrier+NaoAC+100%EtOH)
: 55度dry乾,溶ddH2O 23λ
: ↓
: 用BanHI切/有添加BSA(37度,3hr) 23λ全下补到total:30λ
: ↓
: 做失活(80度,20min)
: ↓
: 跑gel 2λ (argarose,1%)
: 只出现一条>2000bp的band(因为我只用100bp maker)
: 并没有400bp的band
确定你的enzyme buffer有用对吗?
定序後切点的位置有突变吗?
: 注
: T-A vector : 2728bp
: 我想请问:
: 1.为什麽我的insert切不下来?
: 我用Sma I 、BanHI的时间都有加长 大约一倍了
: 也做了失活
: 需要的buffer不同,也有用phenol/chloroform啊
: T-A vector上也确实有Sma I 、BanHI的切位
: 我的inesrt也确定有接在T-A vector上(送过定序)
: 我该如何处理?该改进什麽地方?
: 我在酵素的海报(我忘记哪间公司,好像是NETBIO)
: 对照时发现Sma I 、BanHI交叉点是「连续切位」
: 请问这是什麽意思?
: 会造成digestion失败吗?
意思就是这两种酵素的作用温度不同,buffer也不同,所以不能同时切
要切完一刀再切另一刀的意思
你做的方法就没错啦
: 2.若之後顺利切下後
: 构筑时(一端stick/一端blunt)又如何提高ligation成功率?
: 该注意些什麽技巧?
: 专题作不出来
: 推徵眼看就要到
: 恳请善心人士帮我一下
: 感恩~~鞠躬~~~
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◆ From: 61.217.33.46
1F:推 tincta:我的DNA浓度是1.15 会因此太淡吗? 08/23 02:53