作者rpr (Cathy)
看板Biotech
标题Re: [问题] Real-Time的问题(也有PCR的问题)
时间Wed Sep 13 23:22:17 2006
※ 引述《LBP (幸福已经从指缝间溜走)》之铭言:
: 原本我的real-time一直都做的好好的
: 结果自从有一次跑出来的Ct值忽然很低
: 之前都在28-30之间
: 那一次突然变成20上下
: 我就把real-time的产物拿去跑胶看看是哪里有问题
: 跑出来的结果发现产物竟然不是single band...
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不是single band的话
我会怀疑你的PCR已经有contamination的现象了
是否有的plate/tube没有封好,在高温的情况下PCR产物随着蒸气飘散在block
然後又跑到你的plate/tube里
甚至在你prepair的时候,你所用的东西器具就已经有PCR产物的污染了
(PCR可是很可怕的,只要一点点就可以不断放大啊)
: 可是当初作real-time之前已经用一般的PCR去跑过
: primer应该是没问题的
: 当初跑出来也都呈现很乾净也很sharp的single band
: 竟然好像在一夕之间都做不出来了
: 於是我就回到PCR,想开始逐步找出问题所在
: 我用的cDNA都是同一批
: 起初想说先提高annealing的温度
: 後来怎麽提高都不见改善,想说问题也许在primer
: 没想到今天把新的primer溶好後开始重P
: 竟然还是无法做出当初那样的single band
: 又因为real-time需要一组internal control
: 本来闭着眼睛都做的出来的internal control
: 从那一次问题开始後也是无法出现single band
: 连今天换了新的primer也是一样
: 唉......好无力....已经P了一个多月
: 每天晚上一想到第二天的实验又做不出来
: 就觉得压力好大...心情很不好
: 我做的是hTERT基因的表现
: 请问也有人在做这个的吗?
我看到这里,觉得比较像环境上的污染而非机器污染
如果是我,我会连pipetteman都仔细清过(用酒精擦拭,恐怕连内管都要处理一下),
tip也改用filter tip...
不果我想问一下,你跑胶出来的结果不是single band而是怎样的情况啊?
是多一条band? 还是变成smear?
如果是多一条band,而且在hTERT跟internal control都有一样大的band出现
那我的推测应该就获得证实了...
希望可以帮上忙,也欢迎讨论.
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