Biotech 板


LINE

※ 引述《rpr (Cathy)》之铭言: : ※ 引述《LBP (幸福已经从指缝间溜走)》之铭言: : : 原本我的real-time一直都做的好好的 : : 结果自从有一次跑出来的Ct值忽然很低 : : 之前都在28-30之间 : : 那一次突然变成20上下 : : 我就把real-time的产物拿去跑胶看看是哪里有问题 : : 跑出来的结果发现产物竟然不是single band... : ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ : 不是single band的话 : 我会怀疑你的PCR已经有contamination的现象了 : 是否有的plate/tube没有封好,在高温的情况下PCR产物随着蒸气飘散在block : 然後又跑到你的plate/tube里 : 甚至在你prepair的时候,你所用的东西器具就已经有PCR产物的污染了 : (PCR可是很可怕的,只要一点点就可以不断放大啊) 嗯...你说的这个情况我想暂时是可以排除的 我使用的是ABI原厂8tubes per strip 盖上caps时也是用它专用的黑棒棒(不知道这个叫什麽^^") 所以密封度我想是没问题的 另外我忘了提到 原本都做的出来的real-time,开始出现问题後 我repeat了好几次都一直出现相同的问题--过低的Ct值以及杂band的电泳结果 此外,原文mandible推文提及我原本所谓有做出来的Ct值 是否过高(28-30) 我想应该是还在可以接受的范围内 因为欲增幅的这个片段在一开始的PCR结果中表现就已经偏弱了 於是在real-time会得到偏高的Ct值,我个人觉得是合理的 (如果这样的想法有误请给予指正 ^^" ) : 我看到这里,觉得比较像环境上的污染而非机器污染 : 如果是我,我会连pipetteman都仔细清过(用酒精擦拭,恐怕连内管都要处理一下), : tip也改用filter tip... : 不果我想问一下,你跑胶出来的结果不是single band而是怎样的情况啊? : 是多一条band? 还是变成smear? : 如果是多一条band,而且在hTERT跟internal control都有一样大的band出现 : 那我的推测应该就获得证实了... : 希望可以帮上忙,也欢迎讨论. 我想你的推测应该是对了 因为我今天仔细看着之前的电泳图 发现前几次的结果中,hTERT跟internal control隐约有着一样大小的杂band 然後今天重新换了reaction buf.和dNTP也是出现杂band 我目前是想说可能连最根本的水是污染的 刚刚重新用新拆封的水去稀释cDNA和primer 希望明天可以看到漂亮的data >_< 要是再出不来我也束手无策了吧 T__T --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 163.29.223.14
1F:推 rpr:诚心希望你的cDNA不要也被污染了~或者你能拿到新的cDNA... 09/15 01:19
2F:推 rpr:另外,我也会建议你顺便用70-75%酒精擦拭一下pipetteman跟环境, 09/15 01:23
3F:→ rpr:碰到PCR污染真的很头痛,多作预防措施多安心喽~~Good Luck! 09/15 01:23
4F:推 mandible:是否是PRIMER的问题?cdna污染我想不太可能!! 09/15 10:02
5F:→ mandible:reagent污染不太可能会影响道single BAND 09/15 10:04
6F:推 rpr:如果污染物是个DNA片段,那不管是那一个reagent都会被放大喔! 09/15 14:25
7F:→ rpr:因为看起来他的primer对於该DNA片段也是会放大的 09/15 14:26
8F:→ rpr:reagent指水, primer, dNTP,甚至real-time master mix喔 09/15 14:27







like.gif 您可能会有兴趣的文章
icon.png[问题/行为] 猫晚上进房间会不会有憋尿问题
icon.pngRe: [闲聊] 选了错误的女孩成为魔法少女 XDDDDDDDDDD
icon.png[正妹] 瑞典 一张
icon.png[心得] EMS高领长版毛衣.墨小楼MC1002
icon.png[分享] 丹龙隔热纸GE55+33+22
icon.png[问题] 清洗洗衣机
icon.png[寻物] 窗台下的空间
icon.png[闲聊] 双极の女神1 木魔爵
icon.png[售车] 新竹 1997 march 1297cc 白色 四门
icon.png[讨论] 能从照片感受到摄影者心情吗
icon.png[狂贺] 贺贺贺贺 贺!岛村卯月!总选举NO.1
icon.png[难过] 羡慕白皮肤的女生
icon.png阅读文章
icon.png[黑特]
icon.png[问题] SBK S1安装於安全帽位置
icon.png[分享] 旧woo100绝版开箱!!
icon.pngRe: [无言] 关於小包卫生纸
icon.png[开箱] E5-2683V3 RX480Strix 快睿C1 简单测试
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 执行者16PT
icon.png[售车] 1999年Virage iO 1.8EXi
icon.png[心得] 挑战33 LV10 狮子座pt solo
icon.png[闲聊] 手把手教你不被桶之新手主购教学
icon.png[分享] Civic Type R 量产版官方照无预警流出
icon.png[售车] Golf 4 2.0 银色 自排
icon.png[出售] Graco提篮汽座(有底座)2000元诚可议
icon.png[问题] 请问补牙材质掉了还能再补吗?(台中半年内
icon.png[问题] 44th 单曲 生写竟然都给重复的啊啊!
icon.png[心得] 华南红卡/icash 核卡
icon.png[问题] 拔牙矫正这样正常吗
icon.png[赠送] 老莫高业 初业 102年版
icon.png[情报] 三大行动支付 本季掀战火
icon.png[宝宝] 博客来Amos水蜡笔5/1特价五折
icon.pngRe: [心得] 新鲜人一些面试分享
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 麒麟25PT
icon.pngRe: [闲聊] (君の名は。雷慎入) 君名二创漫画翻译
icon.pngRe: [闲聊] OGN中场影片:失踪人口局 (英文字幕)
icon.png[问题] 台湾大哥大4G讯号差
icon.png[出售] [全国]全新千寻侘草LED灯, 水草

请输入看板名称,例如:Gossiping站内搜寻

TOP