我有个需求，想请大家建议一下。 我手上有八个物种的同一段genomic DNA sequences。 每一条都小於1kb。 我想要一个序列比对後显示sequence conservation的图。 X-轴是DNA 长度，而Y-轴则是保留度的某种计算值(单位)。 看起来像是股市趋势图.... Y-轴值越高则表示保留度越大。 我用ClustalW比对，它只给我序列比对的样子。 没有图。 我有想过把ClustalW比对後的结果一个字母一个字母地输入到Excel， 然後请它帮我画出一张图出来。 可是这麽做有几个问题。 一是太耗时(现在应该没人会这麽做了吧！)， 二是我得解释这种方法和设定的原因，比方说值的给定之类的。 我们实验室对bioinformatics没有概念， 不晓得该怎麽弄才好。 目前是希望网路上能找得到符合或接近我需求的软体。 还请大家建议一下做法或推荐网站。 谢谢！ --

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