作者chiehgriffin (...)
看板Biotech
标题Re: [问题] DNA定序之後的问题
时间Fri Nov 3 15:04:22 2006
※ 引述《lovepig414 (pig)》之铭言:
: 各位大大
: 小弟以本实验室的细胞株做了RT-PCR後,之後再做clone完後,送生技公司做定序,
: 定序完成後,上了NCBI做序列比对,发现自己做的定序和资料库上的定序相似
: 度高达98%,我想应该是很高吧,所以推测此细胞应该是有此基因,然而,我的
: 老板却问我了一个问题,就是为什麽相似度不是100%?要我做回覆!
: 我自己想的结论是:
: 1.也许是机器的问题,本身就有错误率!(但是机器做出错误的
: 机率是很低的!)
: 2.也许是基因上本身就有一点不一样,但是转译出的protein
: ,可能会是相同的!(这个可以做胺基酸比对得知。)
: 再来我就不太知道为什麽了,自己也上网站找寻了一下,但是真的找不太到相
: 关的资料,不知道板上的大大们,有没有人可以帮帮我啊!再过几天就要meeting,
: 可是我却如此的不知所以然,救救我吧! 感恩阿!
可以去看看定序序列的raw data,也就是peak,通常定序的长度差不多都在1Kb或是
少於,而且刚开始或是最後序列无法判定的情形是常见的,建议您亲自看看peak
profile。
另外可能您的基因有mutation也说不定阿!
参考一下...
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 211.76.175.139