作者Mouseking (叫我老鼠王....-_-)
看板Biotech
标题Re: [问题] DNA定序之後的问题
时间Sat Nov 4 01:38:48 2006
※ 引述《chiehgriffin (...)》之铭言:
: ※ 引述《lovepig414 (pig)》之铭言:
: : 各位大大
: : 小弟以本实验室的细胞株做了RT-PCR後,之後再做clone完後,送生技公司做定序,
: : 定序完成後,上了NCBI做序列比对,发现自己做的定序和资料库上的定序相似
: : 度高达98%,我想应该是很高吧,所以推测此细胞应该是有此基因,然而,我的
: : 老板却问我了一个问题,就是为什麽相似度不是100%?要我做回覆!
: : 我自己想的结论是:
: : 1.也许是机器的问题,本身就有错误率!(但是机器做出错误的
: : 机率是很低的!)
: : 2.也许是基因上本身就有一点不一样,但是转译出的protein
: : ,可能会是相同的!(这个可以做胺基酸比对得知。)
: : 再来我就不太知道为什麽了,自己也上网站找寻了一下,但是真的找不太到相
: : 关的资料,不知道板上的大大们,有没有人可以帮帮我啊!再过几天就要meeting,
: : 可是我却如此的不知所以然,救救我吧! 感恩阿!
: 可以去看看定序序列的raw data,也就是peak,通常定序的长度差不多都在1Kb或是
: 少於,而且刚开始或是最後序列无法判定的情形是常见的,建议您亲自看看peak
: profile。
: 另外可能您的基因有mutation也说不定阿!
: 参考一下...
好奇问一下....你有拿掉原先vector上multiple cloning site到使用primer之间的
序列嘛?我上次是忘记拿掉所以没有100%......如果有....我想是机器问题多一点
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 210.58.54.177