作者kaifish (喔.....................)
看板Biotech
标题Re: [问题] primer design问题
时间Mon Nov 6 19:17:07 2006
※ 引述《limiya (陈小咩)》之铭言:
: 我想请问
: 我利用一个软体叫做Beacon_designer设计primer
: 然後跑出一推primer candidate後再去blastn看是否这个primer会和其他的sequence
: 我的问题是
: 通常拿去blast的小片段primer sequence会blast到一堆其他的gene sequence
: 我blast了许久都找不到专一gene的primer
: 请问有人可以提供你们在设计primer上的经验或是方法吗?
: 谢谢~
提供一点小小的经验给您参考
其实Blast出来的片段虽然很相似
但是可以看看〝完全一样〞或是3'端相似的比例有多少
如果3'端一样的比例很少,那麽设计出来的primer有时候还是可以使用的
另外,也许你可以去看一下那些完全一样的序列
有时候不会以基因的名字表示
而是以当初做定序的clone编号命名
其实代表的是同一段基因
给您做个参考
如果有错,也请大家指正,谢谢!
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我不想在球场上当一个没用的人
也许我真得不是很厉害
再练下去也只有这样子...
可是.......我就是会认真地去练习
赌赌看明天会不会变强一点...
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◆ From: 140.112.121.97
1F:→ limiya:谢谢你宝贵的意见 我一定会参考^^ 11/07 11:58