作者ZecAhau (World Peace)
看板Biotech
标题[求救] 请问 genomic DNA 的 PCR
时间Sun Nov 12 19:32:10 2006
各位好
我现在是用 人类细胞株中抽取的 genomic DNA 当作 template 进行 PCR
想要 P 出一段长度约 3 K 的 promoter region
之前可能因为 primer 没有设计好 一直 P 不出来
重新设计 primer 後 是可以在正确位置看得到 band
可是 不管怎麽改变 annealing 的温度 或 DNA template 的量..
甚至是增加 cycle 数 (35 --> 40)
都没有办法让这 band 的 signal 强一点
量一直都非常少....
我的 PCR condition 如下:
98 ℃, 3 min
98 ℃ 1 min
61.0 or 58.0 ℃ 40 sec
72 ℃ 3 min ×35 or 40
72 ℃ 10 min 4 ℃ ∞
DNA template 的量 则是从 3 ng --> 2 ug 都试过了
不是 P 不出 就是只有微弱的 band
Primer 则 FW RV 各加 100ng
要提到的是 因为是 promoter region
两个 primer 都有 GC-rich 的情况
FW 还好 ( 55 %)
但 RV 的 GC 高达 66.67 %
不知道这是否影响了我 PCR 的产率?
还是 DNA template 不够乾净??
或说这样的 PCR 还有什麽需要特别留意的地方??
谢谢各位的指教~~谢谢!!
--
白天不懂夜的黑
太阳不解月的悲
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.60.46
※ 编辑: ZecAhau 来自: 140.109.224.35 (11/12 23:36)