作者Mouseking (叫我老鼠王....-_-)
看板Biotech
标题Re: [问题] 如何计算RT的效率呢?
时间Mon Nov 20 21:01:34 2006
※ 引述《aggaci (学钢琴,左手怎麽那麽笨)》之铭言:
: ※ 引述《hychou (布丁)》之铭言:
: : 板上的前辈们好,
: : 最近在进行RT-PCR,所用的RT为invitrogen的superscript III
: : RT前我先测了total RNA浓度後,以5ug RNA去RT (reaction vol.=20ul)
: : RT结束,我取1ul cDNA来测浓度, 100x稀释 OD260=0.299
: : 其浓度计算是否为0.299x40x100=1.196ng/ul
40核醣核酸(RNA)的常数....不是单股的去氧核醣核酸
: : 这样算的话cDNA不就有1.196x20=23.92ng @@(昏)
: : 请问前辈们,究竟哪里出了问题?
: : 我用random primer来RT,应该不会有影响吧?!
: : 另外,这批RNA的ratio大概都在1.6左右,
: : 这样是否会影响之後的real time PCR反应?
: : 我最烦恼的是standard curve是否会做不好?
: : 谢谢大家帮忙!!
: RT後的cDNA应该无法测cDNA浓度!
: 您想一下ribonucleotide测浓度原理即知
还是有读值没错啊...只是一股是RNA...一股是cDNA....哈妙....
这系数会是多少?我真很好奇....不知有没人知道?
基本上RT做的好不好.....是透过比较housekeeping gene啦
如果你几次实验跑下来Housekeeping gene的 Ct值都差不多...你就算RT高手了
其次,同一trial的standard curve怎做都很漂亮.....只要你的pipette不差
难在inter trial的standard curve........真的要练一阵子....不过这是
real -time PCR最难的部份....在你手法还不稳之前...别轻易下结论喔!切记
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◆ From: 210.58.54.177
1F:推 hychou:感谢前辈的指教(笔记),我会努力练习的. 11/21 11:03