作者shuo218 (快乐的理由)
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标题Re: [求救] 抽pasmid的量都好少
时间Fri Dec 15 22:30:22 2006
※ 引述《puec ()》之铭言:
: ※ 引述《shuo218 (快乐的理由)》之铭言:
: 恩,你的菌养太老了。解决的方法有两个
: 1: 增加抗生素的浓度,(100ug/ml for ampicillin or 25 ug/ml for Kanamycin)
: 2. 缩短养菌的时间。
: 你可能会问,你是照protocol养16小时,为什麽会太老。有几个可能性
: a. 你的抗生素加太少。抗生素浓度越高,只要是在菌可以忍受的范围内,
: plasmid的品质就会越好。
: b. 每只菌在不同的medium里面生长速度不依样,同一种medium用不同牌子
: 的药品配出来的效果也不一样。同一个牌子的药品,用不同的水去配,
: 结果也会不一样。
: c. 你的colony可能很大颗。有可能是菌真的长很好,也有可能你偷懒回家
: 前才挑colony,然後想说隔天下午来抽plasmid就好。反正要放16小时嘛。
: 前一天晚上在实验室混到11点挑colony第二天可以混到下午3点才开始做
: 实验。想想看,2mm的colony里面的菌比1mm的colony多多少?答案是4倍!
: 如果1mm的colony养16小时是刚刚好,那你是人家的四倍,那你养了16小时
: 你的菌量就是人家的4倍。你不觉得很可怕吗?
: 如果你要问"为什麽养太老的菌plasmid会变很少"。
: 因为medium里面的抗生素的量有限,当你养过头以後,medium里面的抗生素都已经被
: 分解光了,这时候一些没有带plasmid或是plasmid量很少的菌就会出头天。因为他们不
: 需要再花时间去复制你的plasmid,所以会长得比有带plasmid的菌还要快,到了最後,
: medium里面大部分就都是没有plasmid的菌了,所以自然你就抽不到plasmid了。
: 希望这可以解决你的问题。
先谢谢这位板友精采详细的解说
根据大家的解答,我想我也发现了自己的问题
(1)摇菌前,我挑的其实不是colony了,可以说是挑了一坨菌到broth里面去长,而且摇
菌的时间还长达快要24小时,所以菌量太多是一个问题所在
但是我想问,因为我们实验室用的是DH-5alpha的E.coli,他的copy number好像并不高,
那如果我照promega的protocol所说的low-copy-number plasmids最多可用到10ml增菌,
那增菌完要抽plasmid时,是不是再分装成较少体积的量再抽会比较好?
那减少养菌时间,那到底要多久呢?其实我养到後面要做实验的时候,都已经可以看到一
些丝状的悬浮物跟沉淀在下面,那样好像就是细菌死掉了?
恩~我想经由大家的解答之後,我再试试看好了,希望能有比较高的浓度
谢谢大家!!
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◆ From: 220.140.37.184
1F:推 HCCY:DH5 alpha 本来就是专门拿来保存plasmid用的 12/16 15:44
2F:→ HCCY:应该不会有这样的问题 12/16 15:44
3F:推 HCCY:如果有很多沉菌 就把管子放斜一点 转速调高一点 12/16 15:47
4F:推 puec:copy number是由replication origin所决定,与菌种无关。 12/16 18:28