作者lakerjackt (NN )
看板Biotech
标题Re: [问题] Real-time PCR
时间Sun Dec 17 15:41:27 2006
※ 引述《rpr (Cathy)》之铭言:
: ※ 引述《lakerjackt (NN )》之铭言:
: : 我的检体有两部分,一种病人,一种正常人,..起初是认为怕抽不太够...
: : 我现在正常人用invtrogen的kit去抽,回溶30ul,30ul全部转,转的总体积约100ul
: : 而病人用微晶出的pre-roche(好像有拼错..哈)的kit去抽,回溶100ul,
: : 分三管去转,每管加30ul的RNA,每馆总体积都约100ul
: : cDNA後来没有稀释5倍..但後来用正常人的cDNA有稀释10倍和100倍
: : 但都做不出来
: : )cDNA,无论是稀释10倍会100倍都只加1ul,反应的总体机是10ul
: : 我目前还没拿病人的cDNA来做...real-time
: : 我猜可能RNA农度太高了,但我pcr还是做的出来阿!!
: : 因为起出是怕说太稀了!!
: : 不然就是你说的...primer要做的size超过200吧..导致不好做
: : 谢谢
: 不客气,大家一起讨论求进步喽~~
: PCR需求比real-time PCR宽松很多,
: 请不要以为"PCR做的出来就一定没问题"比较好喔!
: 虽然说你的RT是东凑西凑kit做出来的
: 我想 你的RNA转cDNA这一步非常的奇怪喔! 你有测过RNA得OD260/280吗?
: 一般都是用1-2ug去转cDNA,反应最後体积是20ul
: 然後再加DEPC-H2O到100ul(就是我所说的5倍稀释.看来你跟我说的是一样的)
: 你这样转cDNA实在是太浪费RNA了啦!
: 不管你加了多少,reverse transcriptase按照protocol来能转的RNA就是1-2ug
: 多加只是浪费
: 我的template也是病人的血球细胞,3ml的全血抽出来的RNA就可以让我做好多次RT
: 再加上你说的internal control Ct也在40左右
: (amplification curve一点都没有上升的趋势吧)
: 我认为是你下的template太稀了(但是10倍应该也只差3点多个cycle,100倍应该是差7)
: 然後再加上你的产物如果又大於200bp,你到底做多大呢??
: (不过,连b-actin都大於200 bp吗?)
: 大概就是它不容易做出来的原因了
谢谢......我了解可能就是做的长度太长...
那我想问一下......cDNA不纯有没有可能抑制real-time的表现
其实就是cDNA里头有剩余的dNTP或可能会抑制的buffer...有办法解决嘛??
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