作者rpr (Cathy)
看板Biotech
标题Re: [问题] Real-time PCR
时间Tue Dec 19 16:42:45 2006
※ 引述《mandible (生化...go go go !!)》之铭言:
: ※ 引述《rpr (Cathy)》之铭言:
: : 其实,抑制物这个问题也不是无法可解
: : 主要就是减少template 的量
: : 但是咧,这又牵涉到你的template浓度的问题了
: : 虽说real-time PCR最少可以侦测到的RNA在pg等级(应该没记错)
: : 但是你的template浓度到底要下多少,这恐怕要稍微考虑一下
: : 下的多,template跟抑制物的量都会高
: : 下的少,两个量也都会少
: : (其实跟我的实验的烦恼好像喔...)
: : 加上试剂又贵,也不敢多试很多种...
: : 只能说
: : Good Luck to you
: 想请问你r大
: 你在做q-pcr时
: 利用RNA做PCR作为NEGATIVE CONTROL时
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: 是否有侦测到萤光?若有Ct大约为多少?
:
不好意思呢! 我不太了解你的意思
你是指NTC(no template control)呢?
还是指NPC(no probe control, 指没有放入TaqMan probe, SYBR green系统不适用)?
但是依照理论
不管是NTC or NPC,在TaqMan系统或者SYBR green系统下都不应该被侦测到
(这样才是negative control啊!)
如果在NTC or NPC有侦测到萤光就要考虑很多事情了
包括TaqMan probe解离,PCR污染, non-specific band, primer dimer等
(前两者适用TaqMan系统,後三者适用SYBR green系统)
其实这些都可以在实验的amplification curve 跟dissociative curve得到资讯
我只有做NTC,40个cycle的反应就是undetermined
早期有在TaqMan系统出现过38-39,
後来是看amplification curve决定是否有污染
但是觉得这样太投机,所以後来就更小心
SYBR green系统下也只相信Ct of NTC=40的data
不知道这样的回答能否解答你的疑惑?
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 163.15.174.204
1F:推 mandible:有的谢谢!! 12/19 17:18
2F:→ mandible:那NTC的话,究是genomic DNA contamination! 12/19 17:19
3F:推 rpr:如果你测RNA的primer没有跨intron的话就应该是了吧... 12/19 22:58