作者werthers6925 (...)
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标题Re: [求救] cloning求救...一直做到怪东西阿
时间Thu Dec 28 01:30:47 2006
※ 引述《ssuny (Cheer up!!!)》之铭言:
: 从事现在在clone的蛋白已经快2个月了...
: 一直没有好的结果...本人做到都快没信心了
: 请各位版友好心帮个忙吧...帮我看看到底是哪里的问题...
: 以下是实验步骤及结果
我特别去查了一下pET32a plasmid map.....
我发现到一件事.....你可能要换restriction enzyme才能做出来.....
原因如下.....
在pET32a map上...Hind III的位置在第173bp而Sal I的位置在第179bp
map上的序列如下:
Sal I
------
------------AAGCTTGTCGAC----------
------
Hind III
你说你pET32a是用Hind III + Sal I cut
在此帮你建立一个观念.....邻近的两个enzyme最好不要一起用
因为当你其中一个enzyme作用时会导致另外一个enzyme无法作用
举例来说: 假设Hind III先作用 作用完後linear plasmid会变成以下情形
Sal I
------
-----A AGCTTGTCGAC--------
-----TTCA ACAGCTG--------
之後,当Sal I准备要作用时, 请你注意一下
在Sal I cut site的左边(5'端)只剩下一个base pair
这种情形大多会影响下一个enzyme的作用力....严重的话会让他无法作用....
所以, 你说你pET32a是用Hind III + Sal I cut......
实际上, 却只是pET32a用Hind III or Sal I cut......
你的clone一定会做不出来............
你试着换另一种enzyme....两个enzyme距离远一点(至少要离3~6 base pair以上)
不同的enzyme所需要的距离也不同, 如何查到这种资讯?
你可以去翻NEB给的catalog......
在最後的附录地方..给了很多restriction enzyme的information....
包括在primer上加restriction enzyme旁边需要留多少base pair作用效果才会好...
oligo-DNA上(例如linear plasmid)旁边要留多少base pair作用效果才会好...
等等......
这些资讯都可以查的到.......
ENB catalog是一本不错的工具书(对常做sub-cloning的人而言)....
对於你的问题....我相信你只要将其中一个enzyme换掉...应该就可以解决....
希望你顺利....
Best.....
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.228.183
1F:推 boyo:版主这篇要m啦 12/28 02:19
2F:推 linzhengzhan:漂亮的解答……大推… 12/28 02:48
3F:推 ZecAhau:真是强者~! 12/28 09:13
4F:推 rebirth:我以前也干过这种事 选了两个太近的RE site 12/28 11:17
5F:推 HIbaby:推 12/28 11:58
6F:推 cyken:距离一个bp的话,Hind3效率是零! Sal1还有61%效率 12/28 13:48
8F:推 microball:用pET vector 的人还真多呀 (茶) 12/28 21:30
9F:推 JeffreyS:推!! 12/29 00:17