作者puec ()
看板Biotech
标题Re: [求救] cloning求救...一直做到怪东西阿
时间Sat Dec 30 18:22:49 2006
※ 引述《ssuny (Cheer up!!!)》之铭言:
: 从事现在在clone的蛋白已经快2个月了...
: 一直没有好的结果...本人做到都快没信心了
: 请各位版友好心帮个忙吧...帮我看看到底是哪里的问题...
: 以下是实验步骤及结果
请问你纯化出来dna的体积是多少,你又load了多少体积的DNA?
1:5的比例我觉得是错的,因为从你的图看起来,insert跟vector的亮度差不多,但是
要记得,越大的fragment抓到的EtBr会越多,所以虽然看起来亮度差不多,dna的量其实
差很多。你应该要将亮度的比例除以分子量的比例。
举例来说,你的两个band看起来是1:1的亮度(insert:vector)分子量的比例,大约是
500:5000=1:10。这样一除,莫耳数比就大约等於1:0.1=10:1,也就是说,在相同体积
里面,insert的莫耳数是vector的10倍。所以,如果你要调到5:1(i:v)的话,取得体积比
应该是1:2 (i:v)。
所以你5:1(i:v)的比例是错的。你这样取,试管中实际的莫耳数比是50:1 (i:v)。
在这种情形下,过多的insert会与vector结合,这会造成一个vector与两个insert
结合,也就是说,用A enzyme切过的那端抓了一个insert,用B enzyme切过的那端也抓了
另一个insert,然後两个insert的另一端分别是A与B enzyme的切位,自然就接不起来。
在这种情形下,你挑到的菌应该就是随机乱接或是rearrangement的结果。看你只挑
了四颗,是不是因为只有长四颗呢?
最後,看你的insert与vector大小的比例,1:5太多了,大概1:3就差不多了。1:5我记得
是当你的insert与vector大小差不多的时候才需要用到。
试试看吧,如果你原本就有除过分子量才去做ligation的话,就当我没说过罗~
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